Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6Y2

LRRC17, Leucine-rich repeat-containing protein 17, humanhuman

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC17Q8N6Y2 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LRRC17Q8N6Y2 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LRRC17Q8N6Y2 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LRRC17Q8N6Y2 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
LRRC17Q8N6Y2 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LRRC17Q8N6Y2 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LRRC17Q8N6Y2 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LRRC17Q8N6Y2 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LRRC17Q8N6Y2 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LRRC17Q8N6Y2 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
LRRC17Q8N6Y2 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LRRC17Q8N6Y2 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LRRC17Q8N6Y2 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LRRC17Q8N6Y2 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LRRC17Q8N6Y2 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LRRC17Q8N6Y2 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LRRC17Q8N6Y2 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LRRC17Q8N6Y2 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LRRC17Q8N6Y2 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LRRC17Q8N6Y2 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LRRC17Q8N6Y2 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LRRC17Q8N6Y2 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LRRC17Q8N6Y2 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
LRRC17Q8N6Y2 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LRRC17Q8N6Y2 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LRRC17Q8N6Y2 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LRRC17Q8N6Y2 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LRRC17Q8N6Y2 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LRRC17Q8N6Y2 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LRRC17Q8N6Y2 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LRRC17Q8N6Y2 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LRRC17Q8N6Y2 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LRRC17Q8N6Y2 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LRRC17Q8N6Y2 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
LRRC17Q8N6Y2 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LRRC17Q8N6Y2 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LRRC17Q8N6Y2 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LRRC17Q8N6Y2 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LRRC17Q8N6Y2 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
LRRC17Q8N6Y2 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LRRC17Q8N6Y2 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
LRRC17Q8N6Y2 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LRRC17Q8N6Y2 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
LRRC17Q8N6Y2 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LRRC17Q8N6Y2 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LRRC17Q8N6Y2 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LRRC17Q8N6Y2 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LRRC17Q8N6Y2 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LRRC17Q8N6Y2 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LRRC17Q8N6Y2 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
LRRC17Q8N6Y2 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LRRC17Q8N6Y2 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LRRC17Q8N6Y2 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LRRC17Q8N6Y2 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LRRC17Q8N6Y2 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LRRC17Q8N6Y2 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
LRRC17Q8N6Y2 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LRRC17Q8N6Y2 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LRRC17Q8N6Y2 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LRRC17Q8N6Y2 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LRRC17Q8N6Y2 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LRRC17Q8N6Y2 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LRRC17Q8N6Y2 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
LRRC17Q8N6Y2 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRRC17Q8N6Y2 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRRC17Q8N6Y2 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LRRC17Q8N6Y2 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LRRC17Q8N6Y2 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
LRRC17Q8N6Y2 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
LRRC17Q8N6Y2 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LRRC17Q8N6Y2 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRRC17Q8N6Y2 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRRC17Q8N6Y2 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRRC17Q8N6Y2 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRRC17Q8N6Y2 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRRC17Q8N6Y2 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRRC17Q8N6Y2 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRRC17Q8N6Y2 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRRC17Q8N6Y2 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRRC17Q8N6Y2 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRRC17Q8N6Y2 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRRC17Q8N6Y2 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRRC17Q8N6Y2 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRRC17Q8N6Y2 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRRC17Q8N6Y2 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRRC17Q8N6Y2 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRRC17Q8N6Y2 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRRC17Q8N6Y2 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRRC17Q8N6Y2 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRRC17Q8N6Y2 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRRC17Q8N6Y2 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRRC17Q8N6Y2 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRRC17Q8N6Y2 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
LRRC17Q8N6Y2 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LRRC17Q8N6Y2 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LRRC17Q8N6Y2 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LRRC17Q8N6Y2 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRRC17Q8N6Y2 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRRC17Q8N6Y2 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRRC17Q8N6Y2 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.4 ms