Protein–RNA interactions for Protein: Q8N402

Putative uncharacterized protein LOC388882, humanhuman

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8N402 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Q8N402 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Q8N402 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Q8N402 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Q8N402 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Q8N402 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Q8N402 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Q8N402 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Q8N402 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Q8N402 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Q8N402 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Q8N402 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Q8N402 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Q8N402 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Q8N402 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Q8N402 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Q8N402 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Q8N402 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Q8N402 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Q8N402 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Q8N402 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Q8N402 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Q8N402 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Q8N402 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Q8N402 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Q8N402 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Q8N402 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Q8N402 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Q8N402 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Q8N402 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Q8N402 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Q8N402 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Q8N402 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Q8N402 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Q8N402 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Q8N402 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Q8N402 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Q8N402 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Q8N402 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Q8N402 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Q8N402 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Q8N402 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Q8N402 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Q8N402 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Q8N402 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Q8N402 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Q8N402 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Q8N402 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Q8N402 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Q8N402 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Q8N402 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Q8N402 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Q8N402 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Q8N402 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Q8N402 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Q8N402 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Q8N402 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Q8N402 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Q8N402 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Q8N402 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Q8N402 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Q8N402 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Q8N402 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Q8N402 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Q8N402 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Q8N402 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Q8N402 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Q8N402 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Q8N402 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Q8N402 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Q8N402 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Q8N402 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Q8N402 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Q8N402 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Q8N402 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Q8N402 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Q8N402 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Q8N402 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Q8N402 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Q8N402 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Q8N402 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Q8N402 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Q8N402 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Q8N402 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Q8N402 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Q8N402 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Q8N402 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Q8N402 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Q8N402 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Q8N402 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Q8N402 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Q8N402 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Q8N402 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Q8N402 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Q8N402 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Q8N402 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Q8N402 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Q8N402 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Q8N402 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Q8N402 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms