Protein–RNA interactions for Protein: Q8IYK2

CCDC105, Coiled-coil domain-containing protein 105, humanhuman

Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC105Q8IYK2 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC105Q8IYK2 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CCDC105Q8IYK2 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCDC105Q8IYK2 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCDC105Q8IYK2 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCDC105Q8IYK2 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCDC105Q8IYK2 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCDC105Q8IYK2 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCDC105Q8IYK2 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCDC105Q8IYK2 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCDC105Q8IYK2 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCDC105Q8IYK2 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC105Q8IYK2 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC105Q8IYK2 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC105Q8IYK2 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC105Q8IYK2 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC105Q8IYK2 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC105Q8IYK2 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC105Q8IYK2 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC105Q8IYK2 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC105Q8IYK2 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC105Q8IYK2 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCDC105Q8IYK2 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCDC105Q8IYK2 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CCDC105Q8IYK2 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CCDC105Q8IYK2 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CCDC105Q8IYK2 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CCDC105Q8IYK2 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CCDC105Q8IYK2 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CCDC105Q8IYK2 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CCDC105Q8IYK2 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CCDC105Q8IYK2 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CCDC105Q8IYK2 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CCDC105Q8IYK2 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CCDC105Q8IYK2 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
CCDC105Q8IYK2 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC105Q8IYK2 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC105Q8IYK2 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC105Q8IYK2 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC105Q8IYK2 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC105Q8IYK2 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCDC105Q8IYK2 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCDC105Q8IYK2 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC105Q8IYK2 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC105Q8IYK2 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC105Q8IYK2 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCDC105Q8IYK2 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
CCDC105Q8IYK2 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCDC105Q8IYK2 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC105Q8IYK2 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC105Q8IYK2 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC105Q8IYK2 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC105Q8IYK2 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC105Q8IYK2 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC105Q8IYK2 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC105Q8IYK2 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC105Q8IYK2 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC105Q8IYK2 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC105Q8IYK2 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC105Q8IYK2 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC105Q8IYK2 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC105Q8IYK2 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC105Q8IYK2 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC105Q8IYK2 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC105Q8IYK2 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCDC105Q8IYK2 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCDC105Q8IYK2 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC105Q8IYK2 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC105Q8IYK2 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
CCDC105Q8IYK2 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.92
CCDC105Q8IYK2 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCDC105Q8IYK2 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
CCDC105Q8IYK2 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CCDC105Q8IYK2 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
CCDC105Q8IYK2 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CCDC105Q8IYK2 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC105Q8IYK2 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC105Q8IYK2 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC105Q8IYK2 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC105Q8IYK2 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC105Q8IYK2 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC105Q8IYK2 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC105Q8IYK2 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC105Q8IYK2 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC105Q8IYK2 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC105Q8IYK2 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC105Q8IYK2 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC105Q8IYK2 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC105Q8IYK2 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCDC105Q8IYK2 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCDC105Q8IYK2 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCDC105Q8IYK2 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCDC105Q8IYK2 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCDC105Q8IYK2 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
CCDC105Q8IYK2 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CCDC105Q8IYK2 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CCDC105Q8IYK2 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
CCDC105Q8IYK2 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCDC105Q8IYK2 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCDC105Q8IYK2 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.7 ms