Protein–RNA interactions for Protein: Q86V35

CABP7, Calcium-binding protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CABP7Q86V35 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
CABP7Q86V35 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
CABP7Q86V35 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
CABP7Q86V35 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CABP7Q86V35 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CABP7Q86V35 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CABP7Q86V35 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CABP7Q86V35 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CABP7Q86V35 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CABP7Q86V35 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CABP7Q86V35 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CABP7Q86V35 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CABP7Q86V35 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
CABP7Q86V35 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
CABP7Q86V35 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CABP7Q86V35 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CABP7Q86V35 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
CABP7Q86V35 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC28.64■■■□□ 2.17
CABP7Q86V35 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CABP7Q86V35 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CABP7Q86V35 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CABP7Q86V35 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CABP7Q86V35 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CABP7Q86V35 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CABP7Q86V35 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CABP7Q86V35 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CABP7Q86V35 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CABP7Q86V35 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CABP7Q86V35 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CABP7Q86V35 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CABP7Q86V35 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CABP7Q86V35 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CABP7Q86V35 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CABP7Q86V35 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CABP7Q86V35 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CABP7Q86V35 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CABP7Q86V35 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CABP7Q86V35 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CABP7Q86V35 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CABP7Q86V35 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CABP7Q86V35 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CABP7Q86V35 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CABP7Q86V35 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CABP7Q86V35 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CABP7Q86V35 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CABP7Q86V35 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CABP7Q86V35 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CABP7Q86V35 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CABP7Q86V35 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CABP7Q86V35 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CABP7Q86V35 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CABP7Q86V35 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CABP7Q86V35 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CABP7Q86V35 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CABP7Q86V35 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CABP7Q86V35 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
CABP7Q86V35 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CABP7Q86V35 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CABP7Q86V35 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CABP7Q86V35 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CABP7Q86V35 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
CABP7Q86V35 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
CABP7Q86V35 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CABP7Q86V35 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CABP7Q86V35 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CABP7Q86V35 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CABP7Q86V35 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CABP7Q86V35 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CABP7Q86V35 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CABP7Q86V35 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CABP7Q86V35 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CABP7Q86V35 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
CABP7Q86V35 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CABP7Q86V35 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CABP7Q86V35 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CABP7Q86V35 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
CABP7Q86V35 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CABP7Q86V35 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
CABP7Q86V35 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CABP7Q86V35 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CABP7Q86V35 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CABP7Q86V35 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CABP7Q86V35 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CABP7Q86V35 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CABP7Q86V35 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
CABP7Q86V35 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
CABP7Q86V35 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CABP7Q86V35 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CABP7Q86V35 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CABP7Q86V35 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CABP7Q86V35 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CABP7Q86V35 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CABP7Q86V35 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CABP7Q86V35 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CABP7Q86V35 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CABP7Q86V35 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
CABP7Q86V35 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
CABP7Q86V35 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
CABP7Q86V35 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CABP7Q86V35 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms