Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z407

CSMD3, CUB and sushi domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 3,707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSMD3Q7Z407 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CSMD3Q7Z407 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CSMD3Q7Z407 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CSMD3Q7Z407 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CSMD3Q7Z407 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CSMD3Q7Z407 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CSMD3Q7Z407 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CSMD3Q7Z407 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CSMD3Q7Z407 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CSMD3Q7Z407 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CSMD3Q7Z407 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CSMD3Q7Z407 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CSMD3Q7Z407 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CSMD3Q7Z407 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CSMD3Q7Z407 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CSMD3Q7Z407 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CSMD3Q7Z407 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CSMD3Q7Z407 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CSMD3Q7Z407 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CSMD3Q7Z407 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CSMD3Q7Z407 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CSMD3Q7Z407 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CSMD3Q7Z407 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSMD3Q7Z407 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSMD3Q7Z407 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSMD3Q7Z407 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSMD3Q7Z407 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CSMD3Q7Z407 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CSMD3Q7Z407 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CSMD3Q7Z407 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CSMD3Q7Z407 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CSMD3Q7Z407 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSMD3Q7Z407 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSMD3Q7Z407 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CSMD3Q7Z407 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CSMD3Q7Z407 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CSMD3Q7Z407 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CSMD3Q7Z407 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CSMD3Q7Z407 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CSMD3Q7Z407 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CSMD3Q7Z407 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CSMD3Q7Z407 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CSMD3Q7Z407 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CSMD3Q7Z407 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CSMD3Q7Z407 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CSMD3Q7Z407 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CSMD3Q7Z407 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CSMD3Q7Z407 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CSMD3Q7Z407 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CSMD3Q7Z407 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CSMD3Q7Z407 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CSMD3Q7Z407 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CSMD3Q7Z407 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CSMD3Q7Z407 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CSMD3Q7Z407 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CSMD3Q7Z407 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CSMD3Q7Z407 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CSMD3Q7Z407 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CSMD3Q7Z407 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CSMD3Q7Z407 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CSMD3Q7Z407 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CSMD3Q7Z407 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CSMD3Q7Z407 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CSMD3Q7Z407 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CSMD3Q7Z407 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CSMD3Q7Z407 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CSMD3Q7Z407 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CSMD3Q7Z407 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CSMD3Q7Z407 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CSMD3Q7Z407 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CSMD3Q7Z407 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CSMD3Q7Z407 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CSMD3Q7Z407 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CSMD3Q7Z407 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CSMD3Q7Z407 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CSMD3Q7Z407 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CSMD3Q7Z407 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CSMD3Q7Z407 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CSMD3Q7Z407 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CSMD3Q7Z407 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CSMD3Q7Z407 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CSMD3Q7Z407 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CSMD3Q7Z407 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CSMD3Q7Z407 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CSMD3Q7Z407 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CSMD3Q7Z407 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CSMD3Q7Z407 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CSMD3Q7Z407 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
CSMD3Q7Z407 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CSMD3Q7Z407 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CSMD3Q7Z407 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
CSMD3Q7Z407 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
CSMD3Q7Z407 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CSMD3Q7Z407 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CSMD3Q7Z407 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CSMD3Q7Z407 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CSMD3Q7Z407 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CSMD3Q7Z407 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CSMD3Q7Z407 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CSMD3Q7Z407 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms