Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSB3

LINC00299, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00299, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00299Q6ZSB3 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LINC00299Q6ZSB3 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LINC00299Q6ZSB3 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LINC00299Q6ZSB3 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LINC00299Q6ZSB3 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LINC00299Q6ZSB3 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
LINC00299Q6ZSB3 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LINC00299Q6ZSB3 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LINC00299Q6ZSB3 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LINC00299Q6ZSB3 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LINC00299Q6ZSB3 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LINC00299Q6ZSB3 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LINC00299Q6ZSB3 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LINC00299Q6ZSB3 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LINC00299Q6ZSB3 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LINC00299Q6ZSB3 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
LINC00299Q6ZSB3 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LINC00299Q6ZSB3 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
LINC00299Q6ZSB3 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LINC00299Q6ZSB3 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LINC00299Q6ZSB3 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LINC00299Q6ZSB3 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LINC00299Q6ZSB3 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LINC00299Q6ZSB3 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LINC00299Q6ZSB3 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LINC00299Q6ZSB3 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LINC00299Q6ZSB3 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
LINC00299Q6ZSB3 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LINC00299Q6ZSB3 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LINC00299Q6ZSB3 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LINC00299Q6ZSB3 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LINC00299Q6ZSB3 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LINC00299Q6ZSB3 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LINC00299Q6ZSB3 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LINC00299Q6ZSB3 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LINC00299Q6ZSB3 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LINC00299Q6ZSB3 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LINC00299Q6ZSB3 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LINC00299Q6ZSB3 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LINC00299Q6ZSB3 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LINC00299Q6ZSB3 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LINC00299Q6ZSB3 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LINC00299Q6ZSB3 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LINC00299Q6ZSB3 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LINC00299Q6ZSB3 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LINC00299Q6ZSB3 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LINC00299Q6ZSB3 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LINC00299Q6ZSB3 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LINC00299Q6ZSB3 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LINC00299Q6ZSB3 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LINC00299Q6ZSB3 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LINC00299Q6ZSB3 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LINC00299Q6ZSB3 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LINC00299Q6ZSB3 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LINC00299Q6ZSB3 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LINC00299Q6ZSB3 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LINC00299Q6ZSB3 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LINC00299Q6ZSB3 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LINC00299Q6ZSB3 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LINC00299Q6ZSB3 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LINC00299Q6ZSB3 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LINC00299Q6ZSB3 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LINC00299Q6ZSB3 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LINC00299Q6ZSB3 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LINC00299Q6ZSB3 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LINC00299Q6ZSB3 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LINC00299Q6ZSB3 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LINC00299Q6ZSB3 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LINC00299Q6ZSB3 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LINC00299Q6ZSB3 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LINC00299Q6ZSB3 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LINC00299Q6ZSB3 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LINC00299Q6ZSB3 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LINC00299Q6ZSB3 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LINC00299Q6ZSB3 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LINC00299Q6ZSB3 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LINC00299Q6ZSB3 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LINC00299Q6ZSB3 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LINC00299Q6ZSB3 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LINC00299Q6ZSB3 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LINC00299Q6ZSB3 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LINC00299Q6ZSB3 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LINC00299Q6ZSB3 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LINC00299Q6ZSB3 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LINC00299Q6ZSB3 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LINC00299Q6ZSB3 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LINC00299Q6ZSB3 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LINC00299Q6ZSB3 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LINC00299Q6ZSB3 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LINC00299Q6ZSB3 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LINC00299Q6ZSB3 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LINC00299Q6ZSB3 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
LINC00299Q6ZSB3 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LINC00299Q6ZSB3 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LINC00299Q6ZSB3 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LINC00299Q6ZSB3 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LINC00299Q6ZSB3 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LINC00299Q6ZSB3 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
LINC00299Q6ZSB3 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LINC00299Q6ZSB3 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms