Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSA7

LRRC55, Leucine-rich repeat-containing protein 55, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC55Q6ZSA7 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
LRRC55Q6ZSA7 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
LRRC55Q6ZSA7 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
LRRC55Q6ZSA7 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
LRRC55Q6ZSA7 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
LRRC55Q6ZSA7 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
LRRC55Q6ZSA7 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
LRRC55Q6ZSA7 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
LRRC55Q6ZSA7 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
LRRC55Q6ZSA7 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
LRRC55Q6ZSA7 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
LRRC55Q6ZSA7 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
LRRC55Q6ZSA7 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
LRRC55Q6ZSA7 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
LRRC55Q6ZSA7 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
LRRC55Q6ZSA7 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
LRRC55Q6ZSA7 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
LRRC55Q6ZSA7 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
LRRC55Q6ZSA7 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
LRRC55Q6ZSA7 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
LRRC55Q6ZSA7 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
LRRC55Q6ZSA7 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.12
LRRC55Q6ZSA7 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
LRRC55Q6ZSA7 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
LRRC55Q6ZSA7 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
LRRC55Q6ZSA7 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
LRRC55Q6ZSA7 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
LRRC55Q6ZSA7 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
LRRC55Q6ZSA7 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
LRRC55Q6ZSA7 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
LRRC55Q6ZSA7 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
LRRC55Q6ZSA7 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
LRRC55Q6ZSA7 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
LRRC55Q6ZSA7 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
LRRC55Q6ZSA7 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
LRRC55Q6ZSA7 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
LRRC55Q6ZSA7 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
LRRC55Q6ZSA7 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
LRRC55Q6ZSA7 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
LRRC55Q6ZSA7 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
LRRC55Q6ZSA7 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
LRRC55Q6ZSA7 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
LRRC55Q6ZSA7 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
LRRC55Q6ZSA7 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
LRRC55Q6ZSA7 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
LRRC55Q6ZSA7 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
LRRC55Q6ZSA7 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
LRRC55Q6ZSA7 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
LRRC55Q6ZSA7 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
LRRC55Q6ZSA7 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
LRRC55Q6ZSA7 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
LRRC55Q6ZSA7 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
LRRC55Q6ZSA7 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
LRRC55Q6ZSA7 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
LRRC55Q6ZSA7 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
LRRC55Q6ZSA7 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
LRRC55Q6ZSA7 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
LRRC55Q6ZSA7 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
LRRC55Q6ZSA7 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
LRRC55Q6ZSA7 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
LRRC55Q6ZSA7 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
LRRC55Q6ZSA7 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
LRRC55Q6ZSA7 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
LRRC55Q6ZSA7 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
LRRC55Q6ZSA7 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
LRRC55Q6ZSA7 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
LRRC55Q6ZSA7 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
LRRC55Q6ZSA7 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
LRRC55Q6ZSA7 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
LRRC55Q6ZSA7 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
LRRC55Q6ZSA7 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
LRRC55Q6ZSA7 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
LRRC55Q6ZSA7 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
LRRC55Q6ZSA7 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
LRRC55Q6ZSA7 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
LRRC55Q6ZSA7 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
LRRC55Q6ZSA7 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
LRRC55Q6ZSA7 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
LRRC55Q6ZSA7 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
LRRC55Q6ZSA7 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
LRRC55Q6ZSA7 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
LRRC55Q6ZSA7 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
LRRC55Q6ZSA7 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
LRRC55Q6ZSA7 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
LRRC55Q6ZSA7 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
LRRC55Q6ZSA7 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
LRRC55Q6ZSA7 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
LRRC55Q6ZSA7 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
LRRC55Q6ZSA7 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
LRRC55Q6ZSA7 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
LRRC55Q6ZSA7 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
LRRC55Q6ZSA7 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
LRRC55Q6ZSA7 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
LRRC55Q6ZSA7 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
LRRC55Q6ZSA7 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
LRRC55Q6ZSA7 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
LRRC55Q6ZSA7 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
LRRC55Q6ZSA7 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
LRRC55Q6ZSA7 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
LRRC55Q6ZSA7 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms