Protein–RNA interactions for Protein: Q6XPR3

RPTN, Repetin, humanhuman

Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPTNQ6XPR3 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RPTNQ6XPR3 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RPTNQ6XPR3 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RPTNQ6XPR3 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RPTNQ6XPR3 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RPTNQ6XPR3 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RPTNQ6XPR3 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RPTNQ6XPR3 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RPTNQ6XPR3 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RPTNQ6XPR3 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RPTNQ6XPR3 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RPTNQ6XPR3 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RPTNQ6XPR3 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RPTNQ6XPR3 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RPTNQ6XPR3 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RPTNQ6XPR3 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
RPTNQ6XPR3 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RPTNQ6XPR3 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RPTNQ6XPR3 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RPTNQ6XPR3 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RPTNQ6XPR3 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RPTNQ6XPR3 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RPTNQ6XPR3 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RPTNQ6XPR3 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RPTNQ6XPR3 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RPTNQ6XPR3 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RPTNQ6XPR3 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RPTNQ6XPR3 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RPTNQ6XPR3 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RPTNQ6XPR3 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RPTNQ6XPR3 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RPTNQ6XPR3 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RPTNQ6XPR3 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RPTNQ6XPR3 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RPTNQ6XPR3 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RPTNQ6XPR3 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RPTNQ6XPR3 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RPTNQ6XPR3 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RPTNQ6XPR3 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RPTNQ6XPR3 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RPTNQ6XPR3 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
RPTNQ6XPR3 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RPTNQ6XPR3 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RPTNQ6XPR3 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RPTNQ6XPR3 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RPTNQ6XPR3 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RPTNQ6XPR3 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RPTNQ6XPR3 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RPTNQ6XPR3 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
RPTNQ6XPR3 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RPTNQ6XPR3 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
RPTNQ6XPR3 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
RPTNQ6XPR3 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RPTNQ6XPR3 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RPTNQ6XPR3 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RPTNQ6XPR3 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RPTNQ6XPR3 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RPTNQ6XPR3 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RPTNQ6XPR3 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RPTNQ6XPR3 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RPTNQ6XPR3 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RPTNQ6XPR3 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RPTNQ6XPR3 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RPTNQ6XPR3 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RPTNQ6XPR3 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RPTNQ6XPR3 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RPTNQ6XPR3 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RPTNQ6XPR3 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
RPTNQ6XPR3 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RPTNQ6XPR3 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RPTNQ6XPR3 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RPTNQ6XPR3 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RPTNQ6XPR3 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RPTNQ6XPR3 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RPTNQ6XPR3 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RPTNQ6XPR3 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RPTNQ6XPR3 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RPTNQ6XPR3 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RPTNQ6XPR3 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RPTNQ6XPR3 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RPTNQ6XPR3 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RPTNQ6XPR3 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RPTNQ6XPR3 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RPTNQ6XPR3 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RPTNQ6XPR3 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
RPTNQ6XPR3 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RPTNQ6XPR3 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
RPTNQ6XPR3 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RPTNQ6XPR3 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
RPTNQ6XPR3 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RPTNQ6XPR3 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RPTNQ6XPR3 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RPTNQ6XPR3 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RPTNQ6XPR3 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RPTNQ6XPR3 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RPTNQ6XPR3 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RPTNQ6XPR3 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RPTNQ6XPR3 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RPTNQ6XPR3 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RPTNQ6XPR3 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.1 ms