Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXH8

CCBE1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCBE1Q6UXH8 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCBE1Q6UXH8 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCBE1Q6UXH8 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCBE1Q6UXH8 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCBE1Q6UXH8 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCBE1Q6UXH8 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCBE1Q6UXH8 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCBE1Q6UXH8 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCBE1Q6UXH8 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCBE1Q6UXH8 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCBE1Q6UXH8 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCBE1Q6UXH8 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCBE1Q6UXH8 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCBE1Q6UXH8 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCBE1Q6UXH8 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCBE1Q6UXH8 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCBE1Q6UXH8 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCBE1Q6UXH8 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCBE1Q6UXH8 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CCBE1Q6UXH8 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCBE1Q6UXH8 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCBE1Q6UXH8 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCBE1Q6UXH8 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCBE1Q6UXH8 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CCBE1Q6UXH8 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCBE1Q6UXH8 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCBE1Q6UXH8 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCBE1Q6UXH8 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCBE1Q6UXH8 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCBE1Q6UXH8 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCBE1Q6UXH8 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCBE1Q6UXH8 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCBE1Q6UXH8 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCBE1Q6UXH8 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCBE1Q6UXH8 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCBE1Q6UXH8 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCBE1Q6UXH8 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCBE1Q6UXH8 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCBE1Q6UXH8 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCBE1Q6UXH8 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCBE1Q6UXH8 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCBE1Q6UXH8 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCBE1Q6UXH8 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCBE1Q6UXH8 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCBE1Q6UXH8 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCBE1Q6UXH8 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCBE1Q6UXH8 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCBE1Q6UXH8 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCBE1Q6UXH8 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCBE1Q6UXH8 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCBE1Q6UXH8 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCBE1Q6UXH8 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCBE1Q6UXH8 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCBE1Q6UXH8 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCBE1Q6UXH8 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCBE1Q6UXH8 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCBE1Q6UXH8 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCBE1Q6UXH8 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCBE1Q6UXH8 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCBE1Q6UXH8 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCBE1Q6UXH8 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCBE1Q6UXH8 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCBE1Q6UXH8 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCBE1Q6UXH8 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCBE1Q6UXH8 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCBE1Q6UXH8 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCBE1Q6UXH8 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCBE1Q6UXH8 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCBE1Q6UXH8 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCBE1Q6UXH8 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCBE1Q6UXH8 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCBE1Q6UXH8 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCBE1Q6UXH8 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCBE1Q6UXH8 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCBE1Q6UXH8 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCBE1Q6UXH8 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CCBE1Q6UXH8 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCBE1Q6UXH8 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCBE1Q6UXH8 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCBE1Q6UXH8 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCBE1Q6UXH8 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
CCBE1Q6UXH8 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCBE1Q6UXH8 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCBE1Q6UXH8 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCBE1Q6UXH8 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCBE1Q6UXH8 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCBE1Q6UXH8 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCBE1Q6UXH8 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CCBE1Q6UXH8 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCBE1Q6UXH8 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCBE1Q6UXH8 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCBE1Q6UXH8 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCBE1Q6UXH8 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCBE1Q6UXH8 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCBE1Q6UXH8 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCBE1Q6UXH8 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCBE1Q6UXH8 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCBE1Q6UXH8 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCBE1Q6UXH8 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCBE1Q6UXH8 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 139.6 ms