Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXC1

MAMDC4, Apical endosomal glycoprotein, humanhuman

Predictions only

Length 1,216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAMDC4Q6UXC1 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
MAMDC4Q6UXC1 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.98■■■□□ 2.23
MAMDC4Q6UXC1 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
MAMDC4Q6UXC1 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
MAMDC4Q6UXC1 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
MAMDC4Q6UXC1 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
MAMDC4Q6UXC1 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
MAMDC4Q6UXC1 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
MAMDC4Q6UXC1 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
MAMDC4Q6UXC1 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
MAMDC4Q6UXC1 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
MAMDC4Q6UXC1 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
MAMDC4Q6UXC1 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
MAMDC4Q6UXC1 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
MAMDC4Q6UXC1 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
MAMDC4Q6UXC1 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
MAMDC4Q6UXC1 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
MAMDC4Q6UXC1 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
MAMDC4Q6UXC1 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
MAMDC4Q6UXC1 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
MAMDC4Q6UXC1 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
MAMDC4Q6UXC1 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
MAMDC4Q6UXC1 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
MAMDC4Q6UXC1 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
MAMDC4Q6UXC1 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
MAMDC4Q6UXC1 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
MAMDC4Q6UXC1 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
MAMDC4Q6UXC1 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
MAMDC4Q6UXC1 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
MAMDC4Q6UXC1 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
MAMDC4Q6UXC1 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
MAMDC4Q6UXC1 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
MAMDC4Q6UXC1 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
MAMDC4Q6UXC1 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
MAMDC4Q6UXC1 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
MAMDC4Q6UXC1 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
MAMDC4Q6UXC1 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
MAMDC4Q6UXC1 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
MAMDC4Q6UXC1 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
MAMDC4Q6UXC1 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
MAMDC4Q6UXC1 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
MAMDC4Q6UXC1 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
MAMDC4Q6UXC1 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
MAMDC4Q6UXC1 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
MAMDC4Q6UXC1 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
MAMDC4Q6UXC1 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
MAMDC4Q6UXC1 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
MAMDC4Q6UXC1 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
MAMDC4Q6UXC1 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
MAMDC4Q6UXC1 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
MAMDC4Q6UXC1 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC28.85■■■□□ 2.21
MAMDC4Q6UXC1 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
MAMDC4Q6UXC1 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
MAMDC4Q6UXC1 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
MAMDC4Q6UXC1 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
MAMDC4Q6UXC1 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.2
MAMDC4Q6UXC1 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
MAMDC4Q6UXC1 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
MAMDC4Q6UXC1 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
MAMDC4Q6UXC1 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
MAMDC4Q6UXC1 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
MAMDC4Q6UXC1 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
MAMDC4Q6UXC1 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
MAMDC4Q6UXC1 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
MAMDC4Q6UXC1 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
MAMDC4Q6UXC1 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
MAMDC4Q6UXC1 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
MAMDC4Q6UXC1 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
MAMDC4Q6UXC1 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
MAMDC4Q6UXC1 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
MAMDC4Q6UXC1 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
MAMDC4Q6UXC1 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
MAMDC4Q6UXC1 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
MAMDC4Q6UXC1 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
MAMDC4Q6UXC1 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
MAMDC4Q6UXC1 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
MAMDC4Q6UXC1 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
MAMDC4Q6UXC1 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
MAMDC4Q6UXC1 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
MAMDC4Q6UXC1 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
MAMDC4Q6UXC1 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
MAMDC4Q6UXC1 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
MAMDC4Q6UXC1 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
MAMDC4Q6UXC1 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
MAMDC4Q6UXC1 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
MAMDC4Q6UXC1 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC28.77■■■□□ 2.2
MAMDC4Q6UXC1 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
MAMDC4Q6UXC1 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
MAMDC4Q6UXC1 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
MAMDC4Q6UXC1 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
MAMDC4Q6UXC1 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
MAMDC4Q6UXC1 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
MAMDC4Q6UXC1 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
MAMDC4Q6UXC1 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
MAMDC4Q6UXC1 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
MAMDC4Q6UXC1 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
MAMDC4Q6UXC1 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
MAMDC4Q6UXC1 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
MAMDC4Q6UXC1 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
MAMDC4Q6UXC1 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10 ms