Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWD8

C16orf54, Transmembrane protein C16orf54, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C16orf54Q6UWD8 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
C16orf54Q6UWD8 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
C16orf54Q6UWD8 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
C16orf54Q6UWD8 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
C16orf54Q6UWD8 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
C16orf54Q6UWD8 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
C16orf54Q6UWD8 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
C16orf54Q6UWD8 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
C16orf54Q6UWD8 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
C16orf54Q6UWD8 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
C16orf54Q6UWD8 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
C16orf54Q6UWD8 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
C16orf54Q6UWD8 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
C16orf54Q6UWD8 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
C16orf54Q6UWD8 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
C16orf54Q6UWD8 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
C16orf54Q6UWD8 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
C16orf54Q6UWD8 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
C16orf54Q6UWD8 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
C16orf54Q6UWD8 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
C16orf54Q6UWD8 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
C16orf54Q6UWD8 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
C16orf54Q6UWD8 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
C16orf54Q6UWD8 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
C16orf54Q6UWD8 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
C16orf54Q6UWD8 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
C16orf54Q6UWD8 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
C16orf54Q6UWD8 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
C16orf54Q6UWD8 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
C16orf54Q6UWD8 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
C16orf54Q6UWD8 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
C16orf54Q6UWD8 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
C16orf54Q6UWD8 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
C16orf54Q6UWD8 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
C16orf54Q6UWD8 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
C16orf54Q6UWD8 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
C16orf54Q6UWD8 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
C16orf54Q6UWD8 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
C16orf54Q6UWD8 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
C16orf54Q6UWD8 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
C16orf54Q6UWD8 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC19.43■□□□□ 0.7
C16orf54Q6UWD8 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
C16orf54Q6UWD8 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC19.43■□□□□ 0.7
C16orf54Q6UWD8 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
C16orf54Q6UWD8 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
C16orf54Q6UWD8 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
C16orf54Q6UWD8 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
C16orf54Q6UWD8 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
C16orf54Q6UWD8 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
C16orf54Q6UWD8 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC19.42■□□□□ 0.7
C16orf54Q6UWD8 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
C16orf54Q6UWD8 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
C16orf54Q6UWD8 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
C16orf54Q6UWD8 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
C16orf54Q6UWD8 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
C16orf54Q6UWD8 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
C16orf54Q6UWD8 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC19.4■□□□□ 0.7
C16orf54Q6UWD8 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
C16orf54Q6UWD8 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
C16orf54Q6UWD8 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.7
C16orf54Q6UWD8 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
C16orf54Q6UWD8 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
C16orf54Q6UWD8 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
C16orf54Q6UWD8 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
C16orf54Q6UWD8 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
C16orf54Q6UWD8 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
C16orf54Q6UWD8 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
C16orf54Q6UWD8 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
C16orf54Q6UWD8 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
C16orf54Q6UWD8 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
C16orf54Q6UWD8 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
C16orf54Q6UWD8 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
C16orf54Q6UWD8 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC19.37■□□□□ 0.69
C16orf54Q6UWD8 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC19.37■□□□□ 0.69
C16orf54Q6UWD8 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
C16orf54Q6UWD8 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
C16orf54Q6UWD8 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
C16orf54Q6UWD8 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
C16orf54Q6UWD8 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
C16orf54Q6UWD8 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
C16orf54Q6UWD8 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
C16orf54Q6UWD8 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
C16orf54Q6UWD8 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
C16orf54Q6UWD8 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
C16orf54Q6UWD8 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
C16orf54Q6UWD8 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
C16orf54Q6UWD8 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
C16orf54Q6UWD8 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
C16orf54Q6UWD8 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
C16orf54Q6UWD8 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
C16orf54Q6UWD8 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
C16orf54Q6UWD8 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
C16orf54Q6UWD8 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
C16orf54Q6UWD8 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
C16orf54Q6UWD8 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.69
C16orf54Q6UWD8 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
C16orf54Q6UWD8 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
C16orf54Q6UWD8 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
C16orf54Q6UWD8 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
C16orf54Q6UWD8 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.3 ms