Protein–RNA interactions for Protein: Q6UVM3

KCNT2, Potassium channel subfamily T member 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNT2Q6UVM3 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
KCNT2Q6UVM3 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
KCNT2Q6UVM3 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
KCNT2Q6UVM3 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
KCNT2Q6UVM3 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
KCNT2Q6UVM3 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
KCNT2Q6UVM3 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
KCNT2Q6UVM3 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
KCNT2Q6UVM3 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
KCNT2Q6UVM3 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
KCNT2Q6UVM3 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
KCNT2Q6UVM3 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
KCNT2Q6UVM3 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
KCNT2Q6UVM3 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
KCNT2Q6UVM3 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
KCNT2Q6UVM3 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
KCNT2Q6UVM3 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
KCNT2Q6UVM3 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
KCNT2Q6UVM3 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
KCNT2Q6UVM3 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
KCNT2Q6UVM3 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
KCNT2Q6UVM3 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
KCNT2Q6UVM3 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
KCNT2Q6UVM3 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
KCNT2Q6UVM3 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
KCNT2Q6UVM3 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
KCNT2Q6UVM3 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
KCNT2Q6UVM3 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
KCNT2Q6UVM3 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
KCNT2Q6UVM3 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
KCNT2Q6UVM3 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
KCNT2Q6UVM3 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
KCNT2Q6UVM3 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
KCNT2Q6UVM3 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
KCNT2Q6UVM3 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
KCNT2Q6UVM3 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
KCNT2Q6UVM3 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
KCNT2Q6UVM3 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
KCNT2Q6UVM3 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
KCNT2Q6UVM3 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
KCNT2Q6UVM3 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
KCNT2Q6UVM3 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
KCNT2Q6UVM3 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
KCNT2Q6UVM3 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
KCNT2Q6UVM3 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
KCNT2Q6UVM3 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
KCNT2Q6UVM3 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
KCNT2Q6UVM3 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
KCNT2Q6UVM3 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
KCNT2Q6UVM3 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
KCNT2Q6UVM3 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
KCNT2Q6UVM3 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
KCNT2Q6UVM3 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
KCNT2Q6UVM3 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
KCNT2Q6UVM3 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
KCNT2Q6UVM3 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
KCNT2Q6UVM3 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
KCNT2Q6UVM3 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
KCNT2Q6UVM3 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
KCNT2Q6UVM3 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
KCNT2Q6UVM3 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
KCNT2Q6UVM3 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
KCNT2Q6UVM3 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.97
KCNT2Q6UVM3 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
KCNT2Q6UVM3 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
KCNT2Q6UVM3 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
KCNT2Q6UVM3 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
KCNT2Q6UVM3 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
KCNT2Q6UVM3 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
KCNT2Q6UVM3 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
KCNT2Q6UVM3 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
KCNT2Q6UVM3 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
KCNT2Q6UVM3 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
KCNT2Q6UVM3 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
KCNT2Q6UVM3 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
KCNT2Q6UVM3 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
KCNT2Q6UVM3 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
KCNT2Q6UVM3 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
KCNT2Q6UVM3 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
KCNT2Q6UVM3 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
KCNT2Q6UVM3 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
KCNT2Q6UVM3 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
KCNT2Q6UVM3 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
KCNT2Q6UVM3 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
KCNT2Q6UVM3 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
KCNT2Q6UVM3 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
KCNT2Q6UVM3 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
KCNT2Q6UVM3 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
KCNT2Q6UVM3 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
KCNT2Q6UVM3 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
KCNT2Q6UVM3 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
KCNT2Q6UVM3 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
KCNT2Q6UVM3 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
KCNT2Q6UVM3 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
KCNT2Q6UVM3 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
KCNT2Q6UVM3 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
KCNT2Q6UVM3 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
KCNT2Q6UVM3 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
KCNT2Q6UVM3 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
KCNT2Q6UVM3 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.9 ms