Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2H8

TMEM53, Transmembrane protein 53, humanhuman

Predictions only

Length 277 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM53Q6P2H8 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMEM53Q6P2H8 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
TMEM53Q6P2H8 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TMEM53Q6P2H8 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TMEM53Q6P2H8 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TMEM53Q6P2H8 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TMEM53Q6P2H8 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMEM53Q6P2H8 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMEM53Q6P2H8 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMEM53Q6P2H8 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMEM53Q6P2H8 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMEM53Q6P2H8 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMEM53Q6P2H8 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMEM53Q6P2H8 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMEM53Q6P2H8 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMEM53Q6P2H8 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMEM53Q6P2H8 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMEM53Q6P2H8 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
TMEM53Q6P2H8 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMEM53Q6P2H8 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMEM53Q6P2H8 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMEM53Q6P2H8 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMEM53Q6P2H8 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMEM53Q6P2H8 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TMEM53Q6P2H8 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM53Q6P2H8 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM53Q6P2H8 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM53Q6P2H8 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM53Q6P2H8 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMEM53Q6P2H8 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMEM53Q6P2H8 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMEM53Q6P2H8 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMEM53Q6P2H8 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM53Q6P2H8 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM53Q6P2H8 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM53Q6P2H8 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMEM53Q6P2H8 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMEM53Q6P2H8 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMEM53Q6P2H8 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMEM53Q6P2H8 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMEM53Q6P2H8 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMEM53Q6P2H8 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMEM53Q6P2H8 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM53Q6P2H8 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM53Q6P2H8 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM53Q6P2H8 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM53Q6P2H8 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM53Q6P2H8 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM53Q6P2H8 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM53Q6P2H8 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM53Q6P2H8 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM53Q6P2H8 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM53Q6P2H8 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM53Q6P2H8 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM53Q6P2H8 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM53Q6P2H8 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM53Q6P2H8 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM53Q6P2H8 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM53Q6P2H8 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM53Q6P2H8 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM53Q6P2H8 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM53Q6P2H8 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM53Q6P2H8 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM53Q6P2H8 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM53Q6P2H8 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM53Q6P2H8 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM53Q6P2H8 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM53Q6P2H8 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM53Q6P2H8 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM53Q6P2H8 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM53Q6P2H8 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.23
TMEM53Q6P2H8 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMEM53Q6P2H8 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
TMEM53Q6P2H8 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMEM53Q6P2H8 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM53Q6P2H8 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM53Q6P2H8 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM53Q6P2H8 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM53Q6P2H8 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM53Q6P2H8 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM53Q6P2H8 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM53Q6P2H8 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM53Q6P2H8 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM53Q6P2H8 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM53Q6P2H8 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM53Q6P2H8 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEM53Q6P2H8 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEM53Q6P2H8 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEM53Q6P2H8 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEM53Q6P2H8 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEM53Q6P2H8 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEM53Q6P2H8 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEM53Q6P2H8 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEM53Q6P2H8 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMEM53Q6P2H8 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMEM53Q6P2H8 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMEM53Q6P2H8 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMEM53Q6P2H8 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMEM53Q6P2H8 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMEM53Q6P2H8 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 154.5 ms