Protein–RNA interactions for Protein: Q6ICL7

SLC35E4, Solute carrier family 35 member E4, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC35E4Q6ICL7 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC35E4Q6ICL7 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC35E4Q6ICL7 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC35E4Q6ICL7 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC35E4Q6ICL7 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC35E4Q6ICL7 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC35E4Q6ICL7 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC35E4Q6ICL7 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC35E4Q6ICL7 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC35E4Q6ICL7 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC35E4Q6ICL7 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC35E4Q6ICL7 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC35E4Q6ICL7 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC35E4Q6ICL7 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC35E4Q6ICL7 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC35E4Q6ICL7 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC35E4Q6ICL7 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC35E4Q6ICL7 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC35E4Q6ICL7 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC35E4Q6ICL7 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC35E4Q6ICL7 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC35E4Q6ICL7 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC35E4Q6ICL7 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC35E4Q6ICL7 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC35E4Q6ICL7 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
SLC35E4Q6ICL7 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
SLC35E4Q6ICL7 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC35E4Q6ICL7 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC35E4Q6ICL7 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC35E4Q6ICL7 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC35E4Q6ICL7 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC35E4Q6ICL7 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC35E4Q6ICL7 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC35E4Q6ICL7 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC35E4Q6ICL7 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC35E4Q6ICL7 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC35E4Q6ICL7 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC35E4Q6ICL7 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC35E4Q6ICL7 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC35E4Q6ICL7 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC35E4Q6ICL7 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC35E4Q6ICL7 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC35E4Q6ICL7 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC35E4Q6ICL7 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC35E4Q6ICL7 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC35E4Q6ICL7 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC35E4Q6ICL7 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC35E4Q6ICL7 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC35E4Q6ICL7 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC35E4Q6ICL7 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC35E4Q6ICL7 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC35E4Q6ICL7 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC35E4Q6ICL7 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC35E4Q6ICL7 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC35E4Q6ICL7 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC35E4Q6ICL7 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC35E4Q6ICL7 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC35E4Q6ICL7 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC35E4Q6ICL7 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC35E4Q6ICL7 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC35E4Q6ICL7 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC35E4Q6ICL7 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC35E4Q6ICL7 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC35E4Q6ICL7 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC35E4Q6ICL7 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC35E4Q6ICL7 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC35E4Q6ICL7 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC35E4Q6ICL7 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC35E4Q6ICL7 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC35E4Q6ICL7 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC35E4Q6ICL7 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC35E4Q6ICL7 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC35E4Q6ICL7 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC35E4Q6ICL7 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC35E4Q6ICL7 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC35E4Q6ICL7 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC35E4Q6ICL7 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC35E4Q6ICL7 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC35E4Q6ICL7 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC35E4Q6ICL7 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC35E4Q6ICL7 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC35E4Q6ICL7 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC35E4Q6ICL7 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLC35E4Q6ICL7 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLC35E4Q6ICL7 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLC35E4Q6ICL7 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLC35E4Q6ICL7 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SLC35E4Q6ICL7 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SLC35E4Q6ICL7 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC35E4Q6ICL7 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC35E4Q6ICL7 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC35E4Q6ICL7 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC35E4Q6ICL7 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC35E4Q6ICL7 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLC35E4Q6ICL7 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLC35E4Q6ICL7 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLC35E4Q6ICL7 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SLC35E4Q6ICL7 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SLC35E4Q6ICL7 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SLC35E4Q6ICL7 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms