Protein–RNA interactions for Protein: Q6DN14

MCTP1, Multiple C2 and transmembrane domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 999 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCTP1Q6DN14 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
MCTP1Q6DN14 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
MCTP1Q6DN14 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
MCTP1Q6DN14 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC29.82■■■□□ 2.36
MCTP1Q6DN14 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
MCTP1Q6DN14 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
MCTP1Q6DN14 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
MCTP1Q6DN14 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
MCTP1Q6DN14 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
MCTP1Q6DN14 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
MCTP1Q6DN14 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
MCTP1Q6DN14 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
MCTP1Q6DN14 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC29.8■■■□□ 2.36
MCTP1Q6DN14 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
MCTP1Q6DN14 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
MCTP1Q6DN14 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
MCTP1Q6DN14 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
MCTP1Q6DN14 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
MCTP1Q6DN14 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
MCTP1Q6DN14 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
MCTP1Q6DN14 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
MCTP1Q6DN14 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
MCTP1Q6DN14 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
MCTP1Q6DN14 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
MCTP1Q6DN14 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
MCTP1Q6DN14 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
MCTP1Q6DN14 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
MCTP1Q6DN14 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
MCTP1Q6DN14 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
MCTP1Q6DN14 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
MCTP1Q6DN14 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
MCTP1Q6DN14 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
MCTP1Q6DN14 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
MCTP1Q6DN14 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC29.75■■■□□ 2.35
MCTP1Q6DN14 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
MCTP1Q6DN14 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
MCTP1Q6DN14 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
MCTP1Q6DN14 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
MCTP1Q6DN14 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
MCTP1Q6DN14 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
MCTP1Q6DN14 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
MCTP1Q6DN14 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
MCTP1Q6DN14 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
MCTP1Q6DN14 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
MCTP1Q6DN14 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
MCTP1Q6DN14 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
MCTP1Q6DN14 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
MCTP1Q6DN14 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
MCTP1Q6DN14 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
MCTP1Q6DN14 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
MCTP1Q6DN14 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
MCTP1Q6DN14 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
MCTP1Q6DN14 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.34
MCTP1Q6DN14 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
MCTP1Q6DN14 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
MCTP1Q6DN14 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
MCTP1Q6DN14 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
MCTP1Q6DN14 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
MCTP1Q6DN14 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
MCTP1Q6DN14 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
MCTP1Q6DN14 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
MCTP1Q6DN14 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
MCTP1Q6DN14 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
MCTP1Q6DN14 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
MCTP1Q6DN14 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
MCTP1Q6DN14 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
MCTP1Q6DN14 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
MCTP1Q6DN14 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
MCTP1Q6DN14 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
MCTP1Q6DN14 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
MCTP1Q6DN14 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
MCTP1Q6DN14 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC29.65■■■□□ 2.34
MCTP1Q6DN14 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
MCTP1Q6DN14 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
MCTP1Q6DN14 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
MCTP1Q6DN14 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
MCTP1Q6DN14 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
MCTP1Q6DN14 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
MCTP1Q6DN14 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.33
MCTP1Q6DN14 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
MCTP1Q6DN14 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
MCTP1Q6DN14 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
MCTP1Q6DN14 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
MCTP1Q6DN14 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
MCTP1Q6DN14 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
MCTP1Q6DN14 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
MCTP1Q6DN14 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
MCTP1Q6DN14 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
MCTP1Q6DN14 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
MCTP1Q6DN14 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
MCTP1Q6DN14 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
MCTP1Q6DN14 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC29.6■■■□□ 2.33
MCTP1Q6DN14 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
MCTP1Q6DN14 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
MCTP1Q6DN14 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
MCTP1Q6DN14 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
MCTP1Q6DN14 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
MCTP1Q6DN14 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
MCTP1Q6DN14 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
MCTP1Q6DN14 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11 ms