Protein–RNA interactions for Protein: Q5T6F2

UBAP2, Ubiquitin-associated protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBAP2Q5T6F2 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
UBAP2Q5T6F2 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
UBAP2Q5T6F2 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
UBAP2Q5T6F2 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
UBAP2Q5T6F2 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
UBAP2Q5T6F2 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
UBAP2Q5T6F2 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
UBAP2Q5T6F2 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
UBAP2Q5T6F2 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
UBAP2Q5T6F2 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
UBAP2Q5T6F2 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
UBAP2Q5T6F2 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
UBAP2Q5T6F2 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
UBAP2Q5T6F2 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
UBAP2Q5T6F2 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
UBAP2Q5T6F2 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
UBAP2Q5T6F2 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
UBAP2Q5T6F2 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
UBAP2Q5T6F2 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
UBAP2Q5T6F2 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
UBAP2Q5T6F2 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
UBAP2Q5T6F2 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
UBAP2Q5T6F2 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
UBAP2Q5T6F2 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
UBAP2Q5T6F2 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
UBAP2Q5T6F2 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
UBAP2Q5T6F2 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
UBAP2Q5T6F2 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
UBAP2Q5T6F2 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
UBAP2Q5T6F2 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
UBAP2Q5T6F2 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
UBAP2Q5T6F2 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
UBAP2Q5T6F2 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
UBAP2Q5T6F2 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
UBAP2Q5T6F2 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
UBAP2Q5T6F2 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
UBAP2Q5T6F2 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.79■■□□□ 1.72
UBAP2Q5T6F2 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
UBAP2Q5T6F2 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
UBAP2Q5T6F2 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
UBAP2Q5T6F2 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
UBAP2Q5T6F2 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
UBAP2Q5T6F2 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
UBAP2Q5T6F2 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
UBAP2Q5T6F2 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
UBAP2Q5T6F2 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
UBAP2Q5T6F2 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
UBAP2Q5T6F2 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
UBAP2Q5T6F2 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
UBAP2Q5T6F2 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
UBAP2Q5T6F2 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
UBAP2Q5T6F2 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
UBAP2Q5T6F2 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
UBAP2Q5T6F2 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
UBAP2Q5T6F2 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
UBAP2Q5T6F2 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
UBAP2Q5T6F2 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
UBAP2Q5T6F2 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
UBAP2Q5T6F2 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
UBAP2Q5T6F2 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
UBAP2Q5T6F2 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
UBAP2Q5T6F2 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
UBAP2Q5T6F2 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
UBAP2Q5T6F2 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
UBAP2Q5T6F2 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
UBAP2Q5T6F2 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
UBAP2Q5T6F2 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
UBAP2Q5T6F2 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
UBAP2Q5T6F2 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
UBAP2Q5T6F2 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
UBAP2Q5T6F2 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
UBAP2Q5T6F2 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
UBAP2Q5T6F2 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
UBAP2Q5T6F2 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
UBAP2Q5T6F2 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
UBAP2Q5T6F2 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
UBAP2Q5T6F2 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
UBAP2Q5T6F2 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
UBAP2Q5T6F2 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
UBAP2Q5T6F2 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
UBAP2Q5T6F2 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
UBAP2Q5T6F2 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
UBAP2Q5T6F2 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
UBAP2Q5T6F2 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
UBAP2Q5T6F2 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
UBAP2Q5T6F2 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
UBAP2Q5T6F2 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
UBAP2Q5T6F2 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
UBAP2Q5T6F2 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
UBAP2Q5T6F2 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
UBAP2Q5T6F2 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
UBAP2Q5T6F2 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
UBAP2Q5T6F2 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
UBAP2Q5T6F2 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
UBAP2Q5T6F2 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
UBAP2Q5T6F2 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
UBAP2Q5T6F2 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
UBAP2Q5T6F2 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
UBAP2Q5T6F2 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
UBAP2Q5T6F2 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms