Protein–RNA interactions for Protein: Q5T200

ZC3H13, Zinc finger CCCH domain-containing protein 13, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,668 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZC3H13Q5T200 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
ZC3H13Q5T200 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
ZC3H13Q5T200 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.83■■■■□ 3.65
ZC3H13Q5T200 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
ZC3H13Q5T200 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC37.82■■■■□ 3.65
ZC3H13Q5T200 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.65
ZC3H13Q5T200 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.65
ZC3H13Q5T200 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC37.82■■■■□ 3.64
ZC3H13Q5T200 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
ZC3H13Q5T200 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
ZC3H13Q5T200 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC37.81■■■■□ 3.64
ZC3H13Q5T200 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
ZC3H13Q5T200 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
ZC3H13Q5T200 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
ZC3H13Q5T200 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
ZC3H13Q5T200 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC37.79■■■■□ 3.64
ZC3H13Q5T200 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC37.79■■■■□ 3.64
ZC3H13Q5T200 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
ZC3H13Q5T200 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC37.78■■■■□ 3.64
ZC3H13Q5T200 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC37.77■■■■□ 3.64
ZC3H13Q5T200 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.76■■■■□ 3.64
ZC3H13Q5T200 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.64
ZC3H13Q5T200 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC37.76■■■■□ 3.64
ZC3H13Q5T200 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
ZC3H13Q5T200 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
ZC3H13Q5T200 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC37.75■■■■□ 3.63
ZC3H13Q5T200 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC37.72■■■■□ 3.63
ZC3H13Q5T200 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
ZC3H13Q5T200 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC37.72■■■■□ 3.63
ZC3H13Q5T200 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC37.72■■■■□ 3.63
ZC3H13Q5T200 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
ZC3H13Q5T200 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
ZC3H13Q5T200 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC37.71■■■■□ 3.63
ZC3H13Q5T200 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC37.71■■■■□ 3.63
ZC3H13Q5T200 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC37.7■■■■□ 3.63
ZC3H13Q5T200 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC37.7■■■■□ 3.63
ZC3H13Q5T200 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
ZC3H13Q5T200 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC37.7■■■■□ 3.63
ZC3H13Q5T200 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
ZC3H13Q5T200 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC37.69■■■■□ 3.62
ZC3H13Q5T200 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
ZC3H13Q5T200 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
ZC3H13Q5T200 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC37.68■■■■□ 3.62
ZC3H13Q5T200 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
ZC3H13Q5T200 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC37.68■■■■□ 3.62
ZC3H13Q5T200 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC37.68■■■■□ 3.62
ZC3H13Q5T200 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
ZC3H13Q5T200 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC37.66■■■■□ 3.62
ZC3H13Q5T200 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
ZC3H13Q5T200 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC37.64■■■■□ 3.62
ZC3H13Q5T200 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
ZC3H13Q5T200 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
ZC3H13Q5T200 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.63■■■■□ 3.62
ZC3H13Q5T200 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC37.63■■■■□ 3.62
ZC3H13Q5T200 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.63■■■■□ 3.61
ZC3H13Q5T200 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC37.63■■■■□ 3.61
ZC3H13Q5T200 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.61
ZC3H13Q5T200 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC37.62■■■■□ 3.61
ZC3H13Q5T200 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC37.62■■■■□ 3.61
ZC3H13Q5T200 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC37.6■■■■□ 3.61
ZC3H13Q5T200 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
ZC3H13Q5T200 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
ZC3H13Q5T200 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC37.6■■■■□ 3.61
ZC3H13Q5T200 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
ZC3H13Q5T200 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.58■■■■□ 3.61
ZC3H13Q5T200 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
ZC3H13Q5T200 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.61
ZC3H13Q5T200 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC37.57■■■■□ 3.61
ZC3H13Q5T200 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.6
ZC3H13Q5T200 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.6
ZC3H13Q5T200 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC37.56■■■■□ 3.6
ZC3H13Q5T200 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
ZC3H13Q5T200 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC37.55■■■■□ 3.6
ZC3H13Q5T200 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
ZC3H13Q5T200 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
ZC3H13Q5T200 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
ZC3H13Q5T200 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
ZC3H13Q5T200 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC37.51■■■■□ 3.6
ZC3H13Q5T200 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC37.5■■■■□ 3.59
ZC3H13Q5T200 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
ZC3H13Q5T200 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
ZC3H13Q5T200 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
ZC3H13Q5T200 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
ZC3H13Q5T200 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
ZC3H13Q5T200 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC37.48■■■■□ 3.59
ZC3H13Q5T200 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC37.48■■■■□ 3.59
ZC3H13Q5T200 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC37.47■■■■□ 3.59
ZC3H13Q5T200 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
ZC3H13Q5T200 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
ZC3H13Q5T200 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC37.46■■■■□ 3.59
ZC3H13Q5T200 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
ZC3H13Q5T200 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC37.45■■■■□ 3.59
ZC3H13Q5T200 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
ZC3H13Q5T200 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC37.45■■■■□ 3.59
ZC3H13Q5T200 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.58
ZC3H13Q5T200 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
ZC3H13Q5T200 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
ZC3H13Q5T200 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
ZC3H13Q5T200 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
ZC3H13Q5T200 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC37.44■■■■□ 3.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms