Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRD0

WASHC2D, WASH complex subunit 2D, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WASHC2DQ5SRD0 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
WASHC2DQ5SRD0 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
WASHC2DQ5SRD0 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
WASHC2DQ5SRD0 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
WASHC2DQ5SRD0 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
WASHC2DQ5SRD0 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
WASHC2DQ5SRD0 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.16■■□□□ 1.62
WASHC2DQ5SRD0 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
WASHC2DQ5SRD0 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
WASHC2DQ5SRD0 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
WASHC2DQ5SRD0 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
WASHC2DQ5SRD0 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
WASHC2DQ5SRD0 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
WASHC2DQ5SRD0 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
WASHC2DQ5SRD0 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
WASHC2DQ5SRD0 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
WASHC2DQ5SRD0 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
WASHC2DQ5SRD0 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
WASHC2DQ5SRD0 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
WASHC2DQ5SRD0 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
WASHC2DQ5SRD0 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
WASHC2DQ5SRD0 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
WASHC2DQ5SRD0 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
WASHC2DQ5SRD0 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
WASHC2DQ5SRD0 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
WASHC2DQ5SRD0 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
WASHC2DQ5SRD0 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
WASHC2DQ5SRD0 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
WASHC2DQ5SRD0 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
WASHC2DQ5SRD0 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
WASHC2DQ5SRD0 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
WASHC2DQ5SRD0 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
WASHC2DQ5SRD0 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
WASHC2DQ5SRD0 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
WASHC2DQ5SRD0 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
WASHC2DQ5SRD0 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
WASHC2DQ5SRD0 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
WASHC2DQ5SRD0 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
WASHC2DQ5SRD0 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
WASHC2DQ5SRD0 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
WASHC2DQ5SRD0 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
WASHC2DQ5SRD0 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
WASHC2DQ5SRD0 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
WASHC2DQ5SRD0 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
WASHC2DQ5SRD0 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
WASHC2DQ5SRD0 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
WASHC2DQ5SRD0 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
WASHC2DQ5SRD0 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
WASHC2DQ5SRD0 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
WASHC2DQ5SRD0 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
WASHC2DQ5SRD0 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
WASHC2DQ5SRD0 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
WASHC2DQ5SRD0 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
WASHC2DQ5SRD0 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
WASHC2DQ5SRD0 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
WASHC2DQ5SRD0 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
WASHC2DQ5SRD0 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
WASHC2DQ5SRD0 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
WASHC2DQ5SRD0 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
WASHC2DQ5SRD0 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
WASHC2DQ5SRD0 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
WASHC2DQ5SRD0 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
WASHC2DQ5SRD0 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
WASHC2DQ5SRD0 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
WASHC2DQ5SRD0 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
WASHC2DQ5SRD0 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
WASHC2DQ5SRD0 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
WASHC2DQ5SRD0 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
WASHC2DQ5SRD0 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
WASHC2DQ5SRD0 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
WASHC2DQ5SRD0 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
WASHC2DQ5SRD0 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
WASHC2DQ5SRD0 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
WASHC2DQ5SRD0 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
WASHC2DQ5SRD0 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
WASHC2DQ5SRD0 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
WASHC2DQ5SRD0 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
WASHC2DQ5SRD0 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
WASHC2DQ5SRD0 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
WASHC2DQ5SRD0 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
WASHC2DQ5SRD0 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
WASHC2DQ5SRD0 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
WASHC2DQ5SRD0 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
WASHC2DQ5SRD0 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
WASHC2DQ5SRD0 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
WASHC2DQ5SRD0 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
WASHC2DQ5SRD0 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
WASHC2DQ5SRD0 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
WASHC2DQ5SRD0 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
WASHC2DQ5SRD0 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
WASHC2DQ5SRD0 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
WASHC2DQ5SRD0 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
WASHC2DQ5SRD0 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
WASHC2DQ5SRD0 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
WASHC2DQ5SRD0 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
WASHC2DQ5SRD0 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
WASHC2DQ5SRD0 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
WASHC2DQ5SRD0 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
WASHC2DQ5SRD0 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
WASHC2DQ5SRD0 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms