Protein–RNA interactions for Protein: Q5KU26

COLEC12, Collectin-12, humanhuman

Predictions only

Length 742 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COLEC12Q5KU26 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
COLEC12Q5KU26 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
COLEC12Q5KU26 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
COLEC12Q5KU26 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
COLEC12Q5KU26 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
COLEC12Q5KU26 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
COLEC12Q5KU26 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
COLEC12Q5KU26 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
COLEC12Q5KU26 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
COLEC12Q5KU26 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
COLEC12Q5KU26 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
COLEC12Q5KU26 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
COLEC12Q5KU26 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
COLEC12Q5KU26 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
COLEC12Q5KU26 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
COLEC12Q5KU26 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
COLEC12Q5KU26 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
COLEC12Q5KU26 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
COLEC12Q5KU26 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
COLEC12Q5KU26 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
COLEC12Q5KU26 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
COLEC12Q5KU26 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
COLEC12Q5KU26 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
COLEC12Q5KU26 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
COLEC12Q5KU26 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
COLEC12Q5KU26 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
COLEC12Q5KU26 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
COLEC12Q5KU26 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
COLEC12Q5KU26 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
COLEC12Q5KU26 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
COLEC12Q5KU26 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
COLEC12Q5KU26 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
COLEC12Q5KU26 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
COLEC12Q5KU26 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
COLEC12Q5KU26 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
COLEC12Q5KU26 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
COLEC12Q5KU26 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
COLEC12Q5KU26 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
COLEC12Q5KU26 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
COLEC12Q5KU26 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
COLEC12Q5KU26 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
COLEC12Q5KU26 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
COLEC12Q5KU26 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
COLEC12Q5KU26 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
COLEC12Q5KU26 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
COLEC12Q5KU26 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
COLEC12Q5KU26 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
COLEC12Q5KU26 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
COLEC12Q5KU26 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
COLEC12Q5KU26 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
COLEC12Q5KU26 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
COLEC12Q5KU26 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
COLEC12Q5KU26 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
COLEC12Q5KU26 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
COLEC12Q5KU26 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
COLEC12Q5KU26 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
COLEC12Q5KU26 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
COLEC12Q5KU26 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
COLEC12Q5KU26 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
COLEC12Q5KU26 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
COLEC12Q5KU26 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
COLEC12Q5KU26 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
COLEC12Q5KU26 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
COLEC12Q5KU26 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
COLEC12Q5KU26 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
COLEC12Q5KU26 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
COLEC12Q5KU26 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
COLEC12Q5KU26 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
COLEC12Q5KU26 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
COLEC12Q5KU26 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
COLEC12Q5KU26 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
COLEC12Q5KU26 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
COLEC12Q5KU26 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
COLEC12Q5KU26 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
COLEC12Q5KU26 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
COLEC12Q5KU26 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
COLEC12Q5KU26 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
COLEC12Q5KU26 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
COLEC12Q5KU26 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
COLEC12Q5KU26 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
COLEC12Q5KU26 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
COLEC12Q5KU26 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
COLEC12Q5KU26 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
COLEC12Q5KU26 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
COLEC12Q5KU26 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
COLEC12Q5KU26 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
COLEC12Q5KU26 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
COLEC12Q5KU26 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
COLEC12Q5KU26 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
COLEC12Q5KU26 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
COLEC12Q5KU26 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
COLEC12Q5KU26 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
COLEC12Q5KU26 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
COLEC12Q5KU26 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
COLEC12Q5KU26 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
COLEC12Q5KU26 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
COLEC12Q5KU26 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
COLEC12Q5KU26 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
COLEC12Q5KU26 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
COLEC12Q5KU26 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms