Protein–RNA interactions for Protein: Q53HC0

CCDC92, Coiled-coil domain-containing protein 92, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC92Q53HC0 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC92Q53HC0 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC92Q53HC0 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC92Q53HC0 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC92Q53HC0 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC92Q53HC0 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC92Q53HC0 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC92Q53HC0 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC92Q53HC0 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC92Q53HC0 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC92Q53HC0 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC92Q53HC0 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC92Q53HC0 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC92Q53HC0 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC92Q53HC0 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC92Q53HC0 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC92Q53HC0 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC92Q53HC0 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC92Q53HC0 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC92Q53HC0 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC92Q53HC0 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC92Q53HC0 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC92Q53HC0 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC92Q53HC0 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC92Q53HC0 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC92Q53HC0 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCDC92Q53HC0 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCDC92Q53HC0 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCDC92Q53HC0 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCDC92Q53HC0 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC92Q53HC0 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC92Q53HC0 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC92Q53HC0 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC92Q53HC0 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC92Q53HC0 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC92Q53HC0 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC92Q53HC0 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC92Q53HC0 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC92Q53HC0 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC92Q53HC0 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC92Q53HC0 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC92Q53HC0 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC92Q53HC0 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC92Q53HC0 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC92Q53HC0 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC92Q53HC0 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC92Q53HC0 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC92Q53HC0 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC92Q53HC0 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC92Q53HC0 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC92Q53HC0 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC92Q53HC0 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC92Q53HC0 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC92Q53HC0 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC92Q53HC0 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC92Q53HC0 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC92Q53HC0 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC92Q53HC0 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC92Q53HC0 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC92Q53HC0 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC92Q53HC0 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC92Q53HC0 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC92Q53HC0 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC92Q53HC0 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC92Q53HC0 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC92Q53HC0 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC92Q53HC0 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC92Q53HC0 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC92Q53HC0 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC92Q53HC0 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC92Q53HC0 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC92Q53HC0 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC92Q53HC0 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC92Q53HC0 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC92Q53HC0 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC92Q53HC0 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC92Q53HC0 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC92Q53HC0 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC92Q53HC0 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC92Q53HC0 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC92Q53HC0 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC92Q53HC0 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC92Q53HC0 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC92Q53HC0 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC92Q53HC0 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC92Q53HC0 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC92Q53HC0 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC92Q53HC0 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC92Q53HC0 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC92Q53HC0 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC92Q53HC0 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC92Q53HC0 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC92Q53HC0 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC92Q53HC0 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC92Q53HC0 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC92Q53HC0 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC92Q53HC0 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC92Q53HC0 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC92Q53HC0 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC92Q53HC0 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms