Protein–RNA interactions for Protein: Q499Y3

Putative uncharacterized protein C10orf88-like, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q499Y3 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Q499Y3 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Q499Y3 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Q499Y3 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Q499Y3 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Q499Y3 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Q499Y3 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Q499Y3 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Q499Y3 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Q499Y3 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Q499Y3 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Q499Y3 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Q499Y3 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Q499Y3 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Q499Y3 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Q499Y3 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Q499Y3 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Q499Y3 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Q499Y3 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Q499Y3 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Q499Y3 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Q499Y3 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Q499Y3 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Q499Y3 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Q499Y3 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Q499Y3 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Q499Y3 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Q499Y3 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Q499Y3 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Q499Y3 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Q499Y3 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Q499Y3 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Q499Y3 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Q499Y3 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Q499Y3 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Q499Y3 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Q499Y3 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Q499Y3 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Q499Y3 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Q499Y3 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
Q499Y3 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Q499Y3 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Q499Y3 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Q499Y3 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Q499Y3 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Q499Y3 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Q499Y3 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Q499Y3 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Q499Y3 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Q499Y3 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Q499Y3 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Q499Y3 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Q499Y3 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Q499Y3 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Q499Y3 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Q499Y3 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Q499Y3 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Q499Y3 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Q499Y3 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Q499Y3 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Q499Y3 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Q499Y3 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Q499Y3 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Q499Y3 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Q499Y3 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Q499Y3 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Q499Y3 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Q499Y3 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Q499Y3 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Q499Y3 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Q499Y3 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Q499Y3 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Q499Y3 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Q499Y3 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Q499Y3 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Q499Y3 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Q499Y3 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Q499Y3 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Q499Y3 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Q499Y3 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Q499Y3 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Q499Y3 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Q499Y3 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Q499Y3 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Q499Y3 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Q499Y3 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Q499Y3 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Q499Y3 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Q499Y3 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Q499Y3 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Q499Y3 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Q499Y3 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Q499Y3 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Q499Y3 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Q499Y3 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Q499Y3 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Q499Y3 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Q499Y3 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Q499Y3 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Q499Y3 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms