Protein–RNA interactions for Protein: Q3MIR4

TMEM30B, Cell cycle control protein 50B, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM30BQ3MIR4 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TMEM30BQ3MIR4 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TMEM30BQ3MIR4 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TMEM30BQ3MIR4 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TMEM30BQ3MIR4 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TMEM30BQ3MIR4 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TMEM30BQ3MIR4 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
TMEM30BQ3MIR4 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TMEM30BQ3MIR4 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TMEM30BQ3MIR4 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TMEM30BQ3MIR4 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TMEM30BQ3MIR4 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TMEM30BQ3MIR4 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TMEM30BQ3MIR4 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TMEM30BQ3MIR4 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
TMEM30BQ3MIR4 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TMEM30BQ3MIR4 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TMEM30BQ3MIR4 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TMEM30BQ3MIR4 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TMEM30BQ3MIR4 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TMEM30BQ3MIR4 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TMEM30BQ3MIR4 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TMEM30BQ3MIR4 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TMEM30BQ3MIR4 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TMEM30BQ3MIR4 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TMEM30BQ3MIR4 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TMEM30BQ3MIR4 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TMEM30BQ3MIR4 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TMEM30BQ3MIR4 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TMEM30BQ3MIR4 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TMEM30BQ3MIR4 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TMEM30BQ3MIR4 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TMEM30BQ3MIR4 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TMEM30BQ3MIR4 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TMEM30BQ3MIR4 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TMEM30BQ3MIR4 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TMEM30BQ3MIR4 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TMEM30BQ3MIR4 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TMEM30BQ3MIR4 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TMEM30BQ3MIR4 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TMEM30BQ3MIR4 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TMEM30BQ3MIR4 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TMEM30BQ3MIR4 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TMEM30BQ3MIR4 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TMEM30BQ3MIR4 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TMEM30BQ3MIR4 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TMEM30BQ3MIR4 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TMEM30BQ3MIR4 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TMEM30BQ3MIR4 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TMEM30BQ3MIR4 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TMEM30BQ3MIR4 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
TMEM30BQ3MIR4 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TMEM30BQ3MIR4 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TMEM30BQ3MIR4 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TMEM30BQ3MIR4 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TMEM30BQ3MIR4 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TMEM30BQ3MIR4 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TMEM30BQ3MIR4 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TMEM30BQ3MIR4 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
TMEM30BQ3MIR4 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TMEM30BQ3MIR4 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TMEM30BQ3MIR4 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
TMEM30BQ3MIR4 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
TMEM30BQ3MIR4 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
TMEM30BQ3MIR4 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
TMEM30BQ3MIR4 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TMEM30BQ3MIR4 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TMEM30BQ3MIR4 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TMEM30BQ3MIR4 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TMEM30BQ3MIR4 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
TMEM30BQ3MIR4 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TMEM30BQ3MIR4 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TMEM30BQ3MIR4 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
TMEM30BQ3MIR4 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TMEM30BQ3MIR4 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TMEM30BQ3MIR4 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
TMEM30BQ3MIR4 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TMEM30BQ3MIR4 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
TMEM30BQ3MIR4 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TMEM30BQ3MIR4 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
TMEM30BQ3MIR4 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
TMEM30BQ3MIR4 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
TMEM30BQ3MIR4 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
TMEM30BQ3MIR4 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TMEM30BQ3MIR4 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
TMEM30BQ3MIR4 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
TMEM30BQ3MIR4 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
TMEM30BQ3MIR4 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TMEM30BQ3MIR4 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
TMEM30BQ3MIR4 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TMEM30BQ3MIR4 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
TMEM30BQ3MIR4 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TMEM30BQ3MIR4 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
TMEM30BQ3MIR4 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TMEM30BQ3MIR4 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
TMEM30BQ3MIR4 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
TMEM30BQ3MIR4 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TMEM30BQ3MIR4 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TMEM30BQ3MIR4 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TMEM30BQ3MIR4 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms