Protein–RNA interactions for Protein: Q3MHD2

LSM12, Protein LSM12 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSM12Q3MHD2 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LSM12Q3MHD2 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LSM12Q3MHD2 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LSM12Q3MHD2 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LSM12Q3MHD2 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LSM12Q3MHD2 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LSM12Q3MHD2 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LSM12Q3MHD2 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LSM12Q3MHD2 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LSM12Q3MHD2 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.65■■□□□ 1.54
LSM12Q3MHD2 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
LSM12Q3MHD2 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
LSM12Q3MHD2 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
LSM12Q3MHD2 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
LSM12Q3MHD2 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
LSM12Q3MHD2 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LSM12Q3MHD2 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LSM12Q3MHD2 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LSM12Q3MHD2 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LSM12Q3MHD2 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LSM12Q3MHD2 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LSM12Q3MHD2 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LSM12Q3MHD2 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LSM12Q3MHD2 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
LSM12Q3MHD2 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LSM12Q3MHD2 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LSM12Q3MHD2 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LSM12Q3MHD2 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LSM12Q3MHD2 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LSM12Q3MHD2 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LSM12Q3MHD2 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LSM12Q3MHD2 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LSM12Q3MHD2 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LSM12Q3MHD2 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LSM12Q3MHD2 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LSM12Q3MHD2 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LSM12Q3MHD2 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LSM12Q3MHD2 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LSM12Q3MHD2 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LSM12Q3MHD2 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LSM12Q3MHD2 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LSM12Q3MHD2 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LSM12Q3MHD2 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LSM12Q3MHD2 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LSM12Q3MHD2 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LSM12Q3MHD2 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LSM12Q3MHD2 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LSM12Q3MHD2 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LSM12Q3MHD2 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LSM12Q3MHD2 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LSM12Q3MHD2 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LSM12Q3MHD2 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LSM12Q3MHD2 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LSM12Q3MHD2 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LSM12Q3MHD2 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LSM12Q3MHD2 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LSM12Q3MHD2 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LSM12Q3MHD2 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LSM12Q3MHD2 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LSM12Q3MHD2 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LSM12Q3MHD2 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LSM12Q3MHD2 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LSM12Q3MHD2 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
LSM12Q3MHD2 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LSM12Q3MHD2 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LSM12Q3MHD2 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LSM12Q3MHD2 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LSM12Q3MHD2 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LSM12Q3MHD2 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LSM12Q3MHD2 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LSM12Q3MHD2 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
LSM12Q3MHD2 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LSM12Q3MHD2 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LSM12Q3MHD2 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LSM12Q3MHD2 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LSM12Q3MHD2 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LSM12Q3MHD2 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LSM12Q3MHD2 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LSM12Q3MHD2 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LSM12Q3MHD2 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LSM12Q3MHD2 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LSM12Q3MHD2 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LSM12Q3MHD2 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LSM12Q3MHD2 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LSM12Q3MHD2 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LSM12Q3MHD2 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LSM12Q3MHD2 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LSM12Q3MHD2 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LSM12Q3MHD2 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LSM12Q3MHD2 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LSM12Q3MHD2 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LSM12Q3MHD2 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LSM12Q3MHD2 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LSM12Q3MHD2 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
LSM12Q3MHD2 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LSM12Q3MHD2 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LSM12Q3MHD2 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LSM12Q3MHD2 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LSM12Q3MHD2 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
LSM12Q3MHD2 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87 ms