Protein–RNA interactions for Protein: Q2WGJ8

TMEM249, Transmembrane protein 249, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM249Q2WGJ8 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
TMEM249Q2WGJ8 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMEM249Q2WGJ8 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMEM249Q2WGJ8 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEM249Q2WGJ8 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEM249Q2WGJ8 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMEM249Q2WGJ8 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM249Q2WGJ8 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM249Q2WGJ8 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM249Q2WGJ8 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM249Q2WGJ8 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM249Q2WGJ8 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM249Q2WGJ8 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMEM249Q2WGJ8 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMEM249Q2WGJ8 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMEM249Q2WGJ8 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMEM249Q2WGJ8 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMEM249Q2WGJ8 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMEM249Q2WGJ8 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMEM249Q2WGJ8 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMEM249Q2WGJ8 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMEM249Q2WGJ8 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMEM249Q2WGJ8 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMEM249Q2WGJ8 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMEM249Q2WGJ8 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMEM249Q2WGJ8 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
TMEM249Q2WGJ8 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMEM249Q2WGJ8 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMEM249Q2WGJ8 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMEM249Q2WGJ8 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMEM249Q2WGJ8 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
TMEM249Q2WGJ8 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
TMEM249Q2WGJ8 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMEM249Q2WGJ8 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMEM249Q2WGJ8 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMEM249Q2WGJ8 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMEM249Q2WGJ8 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMEM249Q2WGJ8 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
TMEM249Q2WGJ8 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TMEM249Q2WGJ8 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TMEM249Q2WGJ8 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TMEM249Q2WGJ8 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TMEM249Q2WGJ8 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TMEM249Q2WGJ8 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TMEM249Q2WGJ8 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TMEM249Q2WGJ8 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TMEM249Q2WGJ8 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TMEM249Q2WGJ8 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TMEM249Q2WGJ8 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TMEM249Q2WGJ8 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TMEM249Q2WGJ8 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
TMEM249Q2WGJ8 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC21.28■■□□□ 1
TMEM249Q2WGJ8 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TMEM249Q2WGJ8 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TMEM249Q2WGJ8 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TMEM249Q2WGJ8 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TMEM249Q2WGJ8 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TMEM249Q2WGJ8 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
TMEM249Q2WGJ8 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TMEM249Q2WGJ8 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC21.27■■□□□ 1
TMEM249Q2WGJ8 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMEM249Q2WGJ8 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMEM249Q2WGJ8 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMEM249Q2WGJ8 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMEM249Q2WGJ8 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMEM249Q2WGJ8 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMEM249Q2WGJ8 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
TMEM249Q2WGJ8 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMEM249Q2WGJ8 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMEM249Q2WGJ8 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMEM249Q2WGJ8 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
TMEM249Q2WGJ8 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMEM249Q2WGJ8 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
TMEM249Q2WGJ8 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMEM249Q2WGJ8 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMEM249Q2WGJ8 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TMEM249Q2WGJ8 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TMEM249Q2WGJ8 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TMEM249Q2WGJ8 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TMEM249Q2WGJ8 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TMEM249Q2WGJ8 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TMEM249Q2WGJ8 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
TMEM249Q2WGJ8 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TMEM249Q2WGJ8 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TMEM249Q2WGJ8 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TMEM249Q2WGJ8 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
TMEM249Q2WGJ8 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TMEM249Q2WGJ8 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TMEM249Q2WGJ8 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TMEM249Q2WGJ8 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TMEM249Q2WGJ8 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TMEM249Q2WGJ8 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
TMEM249Q2WGJ8 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TMEM249Q2WGJ8 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TMEM249Q2WGJ8 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
TMEM249Q2WGJ8 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TMEM249Q2WGJ8 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TMEM249Q2WGJ8 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TMEM249Q2WGJ8 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TMEM249Q2WGJ8 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.9 ms