Protein–RNA interactions for Protein: Q2M1V0

ISX, Intestine-specific homeobox, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ISXQ2M1V0 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ISXQ2M1V0 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ISXQ2M1V0 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ISXQ2M1V0 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
ISXQ2M1V0 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ISXQ2M1V0 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ISXQ2M1V0 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ISXQ2M1V0 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ISXQ2M1V0 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ISXQ2M1V0 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
ISXQ2M1V0 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ISXQ2M1V0 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
ISXQ2M1V0 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ISXQ2M1V0 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ISXQ2M1V0 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
ISXQ2M1V0 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ISXQ2M1V0 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ISXQ2M1V0 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ISXQ2M1V0 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
ISXQ2M1V0 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ISXQ2M1V0 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ISXQ2M1V0 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ISXQ2M1V0 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ISXQ2M1V0 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ISXQ2M1V0 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
ISXQ2M1V0 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ISXQ2M1V0 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ISXQ2M1V0 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ISXQ2M1V0 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
ISXQ2M1V0 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ISXQ2M1V0 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ISXQ2M1V0 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ISXQ2M1V0 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ISXQ2M1V0 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ISXQ2M1V0 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ISXQ2M1V0 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ISXQ2M1V0 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ISXQ2M1V0 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ISXQ2M1V0 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ISXQ2M1V0 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ISXQ2M1V0 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ISXQ2M1V0 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ISXQ2M1V0 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ISXQ2M1V0 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ISXQ2M1V0 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ISXQ2M1V0 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ISXQ2M1V0 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
ISXQ2M1V0 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ISXQ2M1V0 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
ISXQ2M1V0 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ISXQ2M1V0 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ISXQ2M1V0 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ISXQ2M1V0 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ISXQ2M1V0 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ISXQ2M1V0 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ISXQ2M1V0 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ISXQ2M1V0 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ISXQ2M1V0 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ISXQ2M1V0 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ISXQ2M1V0 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ISXQ2M1V0 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ISXQ2M1V0 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ISXQ2M1V0 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ISXQ2M1V0 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ISXQ2M1V0 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ISXQ2M1V0 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ISXQ2M1V0 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
ISXQ2M1V0 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ISXQ2M1V0 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ISXQ2M1V0 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ISXQ2M1V0 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ISXQ2M1V0 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ISXQ2M1V0 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ISXQ2M1V0 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ISXQ2M1V0 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
ISXQ2M1V0 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ISXQ2M1V0 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
ISXQ2M1V0 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
ISXQ2M1V0 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
ISXQ2M1V0 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ISXQ2M1V0 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ISXQ2M1V0 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ISXQ2M1V0 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ISXQ2M1V0 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ISXQ2M1V0 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ISXQ2M1V0 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ISXQ2M1V0 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ISXQ2M1V0 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
ISXQ2M1V0 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
ISXQ2M1V0 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ISXQ2M1V0 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ISXQ2M1V0 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
ISXQ2M1V0 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ISXQ2M1V0 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ISXQ2M1V0 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ISXQ2M1V0 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ISXQ2M1V0 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ISXQ2M1V0 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ISXQ2M1V0 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ISXQ2M1V0 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms