Protein–RNA interactions for Protein: Q29980

MICB, MHC class I polypeptide-related sequence B, humanhuman

Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MICBQ29980 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MICBQ29980 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
MICBQ29980 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
MICBQ29980 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MICBQ29980 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MICBQ29980 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MICBQ29980 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MICBQ29980 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MICBQ29980 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MICBQ29980 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
MICBQ29980 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
MICBQ29980 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MICBQ29980 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MICBQ29980 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
MICBQ29980 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
MICBQ29980 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
MICBQ29980 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
MICBQ29980 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MICBQ29980 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MICBQ29980 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
MICBQ29980 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MICBQ29980 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MICBQ29980 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
MICBQ29980 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MICBQ29980 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MICBQ29980 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MICBQ29980 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MICBQ29980 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MICBQ29980 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
MICBQ29980 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MICBQ29980 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MICBQ29980 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MICBQ29980 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MICBQ29980 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
MICBQ29980 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
MICBQ29980 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
MICBQ29980 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
MICBQ29980 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
MICBQ29980 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MICBQ29980 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
MICBQ29980 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MICBQ29980 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MICBQ29980 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
MICBQ29980 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MICBQ29980 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
MICBQ29980 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
MICBQ29980 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
MICBQ29980 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MICBQ29980 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MICBQ29980 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
MICBQ29980 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MICBQ29980 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MICBQ29980 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MICBQ29980 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MICBQ29980 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MICBQ29980 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MICBQ29980 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MICBQ29980 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MICBQ29980 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
MICBQ29980 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MICBQ29980 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
MICBQ29980 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
MICBQ29980 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MICBQ29980 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
MICBQ29980 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
MICBQ29980 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
MICBQ29980 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MICBQ29980 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
MICBQ29980 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MICBQ29980 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MICBQ29980 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
MICBQ29980 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
MICBQ29980 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MICBQ29980 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
MICBQ29980 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
MICBQ29980 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MICBQ29980 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MICBQ29980 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
MICBQ29980 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
MICBQ29980 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
MICBQ29980 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MICBQ29980 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MICBQ29980 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
MICBQ29980 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MICBQ29980 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MICBQ29980 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
MICBQ29980 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
MICBQ29980 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
MICBQ29980 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
MICBQ29980 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
MICBQ29980 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MICBQ29980 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MICBQ29980 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MICBQ29980 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MICBQ29980 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MICBQ29980 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MICBQ29980 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MICBQ29980 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MICBQ29980 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MICBQ29980 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.5 ms