Protein–RNA interactions for Protein: Q29980

MICB, MHC class I polypeptide-related sequence B, humanhuman

Predictions only

Length 383 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MICBQ29980 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC28.63■■■□□ 2.17
MICBQ29980 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
MICBQ29980 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
MICBQ29980 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
MICBQ29980 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
MICBQ29980 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
MICBQ29980 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
MICBQ29980 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
MICBQ29980 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
MICBQ29980 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
MICBQ29980 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
MICBQ29980 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
MICBQ29980 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
MICBQ29980 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
MICBQ29980 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
MICBQ29980 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
MICBQ29980 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
MICBQ29980 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
MICBQ29980 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
MICBQ29980 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
MICBQ29980 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
MICBQ29980 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
MICBQ29980 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
MICBQ29980 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
MICBQ29980 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
MICBQ29980 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
MICBQ29980 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.84
MICBQ29980 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
MICBQ29980 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
MICBQ29980 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
MICBQ29980 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
MICBQ29980 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
MICBQ29980 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
MICBQ29980 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
MICBQ29980 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
MICBQ29980 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
MICBQ29980 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
MICBQ29980 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
MICBQ29980 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
MICBQ29980 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
MICBQ29980 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
MICBQ29980 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
MICBQ29980 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
MICBQ29980 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
MICBQ29980 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
MICBQ29980 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
MICBQ29980 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
MICBQ29980 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MICBQ29980 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
MICBQ29980 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
MICBQ29980 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
MICBQ29980 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
MICBQ29980 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
MICBQ29980 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
MICBQ29980 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
MICBQ29980 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MICBQ29980 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MICBQ29980 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
MICBQ29980 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MICBQ29980 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
MICBQ29980 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MICBQ29980 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MICBQ29980 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
MICBQ29980 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
MICBQ29980 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MICBQ29980 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MICBQ29980 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
MICBQ29980 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MICBQ29980 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MICBQ29980 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MICBQ29980 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MICBQ29980 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MICBQ29980 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
MICBQ29980 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MICBQ29980 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MICBQ29980 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MICBQ29980 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
MICBQ29980 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
MICBQ29980 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MICBQ29980 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
MICBQ29980 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MICBQ29980 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MICBQ29980 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MICBQ29980 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
MICBQ29980 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MICBQ29980 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MICBQ29980 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MICBQ29980 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MICBQ29980 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
MICBQ29980 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MICBQ29980 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MICBQ29980 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MICBQ29980 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MICBQ29980 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MICBQ29980 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MICBQ29980 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MICBQ29980 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MICBQ29980 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MICBQ29980 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MICBQ29980 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.4 ms