Protein–RNA interactions for Protein: Q16384

SSX1, Protein SSX1, humanhuman

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Length 188 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX1Q16384 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SSX1Q16384 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SSX1Q16384 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SSX1Q16384 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SSX1Q16384 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SSX1Q16384 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SSX1Q16384 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SSX1Q16384 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SSX1Q16384 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SSX1Q16384 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SSX1Q16384 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SSX1Q16384 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SSX1Q16384 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SSX1Q16384 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SSX1Q16384 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SSX1Q16384 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SSX1Q16384 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SSX1Q16384 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SSX1Q16384 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SSX1Q16384 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SSX1Q16384 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SSX1Q16384 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SSX1Q16384 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SSX1Q16384 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SSX1Q16384 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SSX1Q16384 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SSX1Q16384 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SSX1Q16384 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SSX1Q16384 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SSX1Q16384 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SSX1Q16384 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SSX1Q16384 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SSX1Q16384 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SSX1Q16384 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SSX1Q16384 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SSX1Q16384 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SSX1Q16384 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SSX1Q16384 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SSX1Q16384 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SSX1Q16384 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SSX1Q16384 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SSX1Q16384 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SSX1Q16384 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SSX1Q16384 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SSX1Q16384 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SSX1Q16384 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SSX1Q16384 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SSX1Q16384 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SSX1Q16384 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SSX1Q16384 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SSX1Q16384 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SSX1Q16384 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SSX1Q16384 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SSX1Q16384 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SSX1Q16384 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SSX1Q16384 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SSX1Q16384 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SSX1Q16384 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SSX1Q16384 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SSX1Q16384 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SSX1Q16384 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SSX1Q16384 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SSX1Q16384 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SSX1Q16384 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SSX1Q16384 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SSX1Q16384 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SSX1Q16384 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SSX1Q16384 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SSX1Q16384 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SSX1Q16384 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SSX1Q16384 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SSX1Q16384 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SSX1Q16384 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SSX1Q16384 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SSX1Q16384 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SSX1Q16384 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SSX1Q16384 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SSX1Q16384 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SSX1Q16384 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SSX1Q16384 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SSX1Q16384 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SSX1Q16384 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SSX1Q16384 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SSX1Q16384 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SSX1Q16384 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SSX1Q16384 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SSX1Q16384 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SSX1Q16384 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SSX1Q16384 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SSX1Q16384 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SSX1Q16384 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SSX1Q16384 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SSX1Q16384 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SSX1Q16384 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SSX1Q16384 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SSX1Q16384 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SSX1Q16384 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SSX1Q16384 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SSX1Q16384 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SSX1Q16384 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
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