Protein–RNA interactions for Protein: Q14050

COL9A3, Collagen alpha-3(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 684 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A3Q14050 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
COL9A3Q14050 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
COL9A3Q14050 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
COL9A3Q14050 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
COL9A3Q14050 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
COL9A3Q14050 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC30.18■■■□□ 2.42
COL9A3Q14050 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
COL9A3Q14050 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
COL9A3Q14050 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
COL9A3Q14050 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC30.17■■■□□ 2.42
COL9A3Q14050 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC30.17■■■□□ 2.42
COL9A3Q14050 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
COL9A3Q14050 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
COL9A3Q14050 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
COL9A3Q14050 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
COL9A3Q14050 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
COL9A3Q14050 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
COL9A3Q14050 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
COL9A3Q14050 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
COL9A3Q14050 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
COL9A3Q14050 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
COL9A3Q14050 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
COL9A3Q14050 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
COL9A3Q14050 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC30.13■■■□□ 2.41
COL9A3Q14050 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
COL9A3Q14050 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC30.12■■■□□ 2.41
COL9A3Q14050 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
COL9A3Q14050 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
COL9A3Q14050 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
COL9A3Q14050 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
COL9A3Q14050 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
COL9A3Q14050 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
COL9A3Q14050 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
COL9A3Q14050 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
COL9A3Q14050 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
COL9A3Q14050 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
COL9A3Q14050 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
COL9A3Q14050 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
COL9A3Q14050 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC30.08■■■□□ 2.41
COL9A3Q14050 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
COL9A3Q14050 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
COL9A3Q14050 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
COL9A3Q14050 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
COL9A3Q14050 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
COL9A3Q14050 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
COL9A3Q14050 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
COL9A3Q14050 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
COL9A3Q14050 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
COL9A3Q14050 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
COL9A3Q14050 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
COL9A3Q14050 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
COL9A3Q14050 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
COL9A3Q14050 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC30.04■■■□□ 2.4
COL9A3Q14050 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
COL9A3Q14050 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
COL9A3Q14050 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
COL9A3Q14050 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
COL9A3Q14050 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC30.02■■■□□ 2.4
COL9A3Q14050 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
COL9A3Q14050 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC30.02■■■□□ 2.4
COL9A3Q14050 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
COL9A3Q14050 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
COL9A3Q14050 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
COL9A3Q14050 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC30.01■■■□□ 2.39
COL9A3Q14050 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
COL9A3Q14050 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC30■■■□□ 2.39
COL9A3Q14050 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC30■■■□□ 2.39
COL9A3Q14050 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
COL9A3Q14050 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
COL9A3Q14050 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
COL9A3Q14050 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
COL9A3Q14050 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
COL9A3Q14050 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
COL9A3Q14050 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
COL9A3Q14050 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC29.95■■■□□ 2.39
COL9A3Q14050 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
COL9A3Q14050 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
COL9A3Q14050 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
COL9A3Q14050 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
COL9A3Q14050 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
COL9A3Q14050 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
COL9A3Q14050 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
COL9A3Q14050 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
COL9A3Q14050 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
COL9A3Q14050 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
COL9A3Q14050 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
COL9A3Q14050 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
COL9A3Q14050 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
COL9A3Q14050 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
COL9A3Q14050 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
COL9A3Q14050 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
COL9A3Q14050 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
COL9A3Q14050 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
COL9A3Q14050 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC29.91■■■□□ 2.38
COL9A3Q14050 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
COL9A3Q14050 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
COL9A3Q14050 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
COL9A3Q14050 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
COL9A3Q14050 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
COL9A3Q14050 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
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