Protein–RNA interactions for Protein: Q12874

SF3A3, Splicing factor 3A subunit 3, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 501 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3A3Q12874 TTLL3-218ENST00000443148 2031 ntTSL 215.43■□□□□ 0.061e-6■■■■■ 58.2
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SF3A3Q12874 TTLL3-232ENST00000496526 5282 ntTSL 211.73□□□□□ -0.531e-6■■■■■ 58.2
SF3A3Q12874 TTLL3-201ENST00000310252 1561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best)11.28□□□□□ -0.61e-6■■■■■ 58.2
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SF3A3Q12874 TTLL3-228ENST00000483051 4176 ntTSL 510.12□□□□□ -0.791e-6■■■■■ 58.2
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SF3A3Q12874 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.132e-6■■■■■ 57.1
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SF3A3Q12874 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.174e-9■■■■■ 57
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SF3A3Q12874 FOCAD-202ENST00000380249 6096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.413e-15■■■■■ 56.8
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SF3A3Q12874 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.412e-7■■■■■ 56.7
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SF3A3Q12874 SPATA20-227ENST00000634597 2587 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.012e-7■■■■■ 56.7
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SF3A3Q12874 SPATA20-204ENST00000503063 3232 ntTSL 214.1□□□□□ -0.152e-7■■■■■ 56.7
SF3A3Q12874 SPATA20-208ENST00000504334 3539 ntTSL 213.91□□□□□ -0.182e-7■■■■■ 56.7
SF3A3Q12874 COL27A1-206ENST00000490831 666 ntTSL 313.4□□□□□ -0.265e-7■■■■■ 56.6
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SF3A3Q12874 RBM6-212ENST00000446471 695 ntTSL 47.41□□□□□ -1.223e-11■■■■■ 56.6
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SF3A3Q12874 FAM129B-207ENST00000484348 654 ntTSL 1 (best)20.23■□□□□ 0.836e-14■■■■■ 56.1
SF3A3Q12874 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.676e-14■■■■■ 56.1
SF3A3Q12874 FAM129B-202ENST00000373314 3760 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.066e-14■■■■■ 56.1
SF3A3Q12874 FAM129B-206ENST00000478917 362 ntTSL 512.58□□□□□ -0.46e-14■■■■■ 56.1
SF3A3Q12874 FAM129B-204ENST00000468379 828 ntTSL 312.35□□□□□ -0.436e-14■■■■■ 56.1
SF3A3Q12874 NCAPG2-208ENST00000474940 583 ntTSL 411.46□□□□□ -0.571e-7■■■■■ 56.1
SF3A3Q12874 PAN2-208ENST00000547994 2605 ntTSL 1 (best)10.69□□□□□ -0.71e-7■■■■■ 56.1
SF3A3Q12874 PAN2-210ENST00000548982 408 ntTSL 310.33□□□□□ -0.761e-7■■■■■ 56.1
SF3A3Q12874 PAN2-219ENST00000552868 469 ntTSL 310.06□□□□□ -0.81e-7■■■■■ 56.1
SF3A3Q12874 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.143e-9■■■■■ 56.1
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SF3A3Q12874 PIGG-209ENST00000504879 445 ntTSL 312.22□□□□□ -0.458e-8■■■■■ 56
SF3A3Q12874 PIGG-223ENST00000513239 3519 ntTSL 1 (best)11.7□□□□□ -0.548e-8■■■■■ 56
SF3A3Q12874 RNF44-208ENST00000515051 596 ntTSL 412.02□□□□□ -0.493e-10■■■■■ 55.8
SF3A3Q12874 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.441e-6■■■■■ 55.8
SF3A3Q12874 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.441e-6■■■■■ 55.8
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