RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000438141.5

TTLL3-215, Transcript of tubulin tyrosine ligase like 3, humanhuman

TSL 2

Gene TTLL3, Length 1,743 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL3-215ENST00000438141 NISCHQ9Y2I1 1504 aa29.2■■■□□ 2.27
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TTLL3-215ENST00000438141 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa23.96■■□□□ 1.43
TTLL3-215ENST00000438141 DCAF8L2P0C7V8 631 aa23.88■■□□□ 1.41
TTLL3-215ENST00000438141 MYO15BQ96JP2 1530 aa23.77■■□□□ 1.4
TTLL3-215ENST00000438141 ABCC9O60706 1549 aa23.67■■□□□ 1.38
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TTLL3-215ENST00000438141 SCRIBQ14160 1630 aa23.33■■□□□ 1.33
TTLL3-215ENST00000438141 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa23.23■■□□□ 1.31
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TTLL3-215ENST00000438141 BICRAQ9NZM4 1560 aa22.61■■□□□ 1.21
TTLL3-215ENST00000438141 MROH2BQ7Z745 1585 aa22.59■■□□□ 1.21
TTLL3-215ENST00000438141 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP22.52■■□□□ 1.19
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TTLL3-215ENST00000438141 CHIC1Q5VXU3 224 aa22.37■■□□□ 1.17
TTLL3-215ENST00000438141 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP22.35■■□□□ 1.172e-6■■□□□ 13.1
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TTLL3-215ENST00000438141 PEG3Q9GZU2 1588 aa22.14■■□□□ 1.14
TTLL3-215ENST00000438141 SMARCA2P51531 1590 aa22.01■■□□□ 1.11
TTLL3-215ENST00000438141 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP22.01■■□□□ 1.11
TTLL3-215ENST00000438141 CCDC88BA6NC98 1476 aa21.95■■□□□ 1.1
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TTLL3-215ENST00000438141 HMGXB3Q12766 1538 aa21.72■■□□□ 1.07
TTLL3-215ENST00000438141 NCAPD3P42695 1498 aa21.71■■□□□ 1.07
TTLL3-215ENST00000438141 ABCC8Q09428 1581 aa21.6■■□□□ 1.05
TTLL3-215ENST00000438141 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa21.5■■□□□ 1.03
TTLL3-215ENST00000438141 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa21.46■■□□□ 1.03
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TTLL3-215ENST00000438141 SOGA1O94964 1423 aa21.23■□□□□ 0.99
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TTLL3-215ENST00000438141 EEA1Q15075 1411 aa21.22■□□□□ 0.99
TTLL3-215ENST00000438141 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa21.21■□□□□ 0.99
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TTLL3-215ENST00000438141 CUX1P39880 1505 aa21.1■□□□□ 0.97
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TTLL3-215ENST00000438141 CEP162Q5TB80 1403 aa20.85■□□□□ 0.93
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TTLL3-215ENST00000438141 ERICH3Q5RHP9 1530 aa20.78■□□□□ 0.92
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TTLL3-215ENST00000438141 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP20.68■□□□□ 0.9
TTLL3-215ENST00000438141 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa20.63■□□□□ 0.89
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TTLL3-215ENST00000438141 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa20.6■□□□□ 0.89
TTLL3-215ENST00000438141 VPS8Q8N3P4 1428 aa20.49■□□□□ 0.87
TTLL3-215ENST00000438141 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa20.49■□□□□ 0.87
TTLL3-215ENST00000438141 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa20.48■□□□□ 0.87
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TTLL3-215ENST00000438141 HRCP23327 699 aa20.44■□□□□ 0.86
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TTLL3-215ENST00000438141 ARAP1Q96P48 1450 aa20.43■□□□□ 0.86
TTLL3-215ENST00000438141 WDR62O43379 1518 aa20.37■□□□□ 0.85
TTLL3-215ENST00000438141 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa20.36■□□□□ 0.85
TTLL3-215ENST00000438141 GAPVD1Q14C86 1478 aa20.36■□□□□ 0.85
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TTLL3-215ENST00000438141 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.84
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TTLL3-215ENST00000438141 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
TTLL3-215ENST00000438141 PBRM1Q86U86 1689 aa20.27■□□□□ 0.84
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TTLL3-215ENST00000438141 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP20.21■□□□□ 0.83
TTLL3-215ENST00000438141 EFCAB5A4FU69 1503 aa20.19■□□□□ 0.82
TTLL3-215ENST00000438141 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP20.18■□□□□ 0.823e-11■■■■■ 47.8
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