RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000473661.5

TTLL3-225, Transcript of tubulin tyrosine ligase like 3, humanhuman

TSL 5

Gene TTLL3, Length 3,811 nt, Biotype nonsense mediated decay.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL3-225ENST00000473661 NISCHQ9Y2I1 1504 aa23.69■■□□□ 1.38
TTLL3-225ENST00000473661 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa20.64■□□□□ 0.9
TTLL3-225ENST00000473661 DCAF8L2P0C7V8 631 aa19.99■□□□□ 0.79
TTLL3-225ENST00000473661 ABCC9O60706 1549 aa19.87■□□□□ 0.77
TTLL3-225ENST00000473661 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP19.82■□□□□ 0.76
TTLL3-225ENST00000473661 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa19.53■□□□□ 0.72
TTLL3-225ENST00000473661 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa19.39■□□□□ 0.7
TTLL3-225ENST00000473661 NACADO15069 1562 aa19.36■□□□□ 0.69
TTLL3-225ENST00000473661 MYO15BQ96JP2 1530 aa19.36■□□□□ 0.69
TTLL3-225ENST00000473661 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa19.26■□□□□ 0.67
TTLL3-225ENST00000473661 SCRIBQ14160 1630 aa19.06■□□□□ 0.64
TTLL3-225ENST00000473661 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP18.78■□□□□ 0.62e-6■■□□□ 13.1
TTLL3-225ENST00000473661 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP18.67■□□□□ 0.58
TTLL3-225ENST00000473661 UNC13AQ9UPW8 1703 aa18.65■□□□□ 0.58
TTLL3-225ENST00000473661 BICRAQ9NZM4 1560 aa18.54■□□□□ 0.56
TTLL3-225ENST00000473661 CECR2Q9BXF3 1484 aa18.43■□□□□ 0.54
TTLL3-225ENST00000473661 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP18.34■□□□□ 0.53
TTLL3-225ENST00000473661 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP18.34■□□□□ 0.53
TTLL3-225ENST00000473661 MROH2BQ7Z745 1585 aa18.28■□□□□ 0.52
TTLL3-225ENST00000473661 SMARCA4P51532 1647 aa18.21■□□□□ 0.51
TTLL3-225ENST00000473661 WIZO95785 1651 aa18.09■□□□□ 0.49
TTLL3-225ENST00000473661 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP18.09■□□□□ 0.49
TTLL3-225ENST00000473661 SMARCA2P51531 1590 aa18.02■□□□□ 0.47
TTLL3-225ENST00000473661 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa18.01■□□□□ 0.47
TTLL3-225ENST00000473661 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP17.97■□□□□ 0.47
TTLL3-225ENST00000473661 PEG3Q9GZU2 1588 aa17.93■□□□□ 0.46
TTLL3-225ENST00000473661 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP17.93■□□□□ 0.46
TTLL3-225ENST00000473661 NCAPD3P42695 1498 aa17.88■□□□□ 0.45
TTLL3-225ENST00000473661 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa17.87■□□□□ 0.45
TTLL3-225ENST00000473661 HMGXB3Q12766 1538 aa17.8■□□□□ 0.44
TTLL3-225ENST00000473661 CCDC88BA6NC98 1476 aa17.79■□□□□ 0.44
TTLL3-225ENST00000473661 CHIC1Q5VXU3 224 aa17.66■□□□□ 0.42
TTLL3-225ENST00000473661 DNAJC5BQ9UF47 199 aa17.63■□□□□ 0.41
TTLL3-225ENST00000473661 TRIM41Q8WV44 630 aa17.56■□□□□ 0.4
TTLL3-225ENST00000473661 CADPSQ9ULU8 1353 aa17.49■□□□□ 0.39
TTLL3-225ENST00000473661 CFTRP13569 1480 aa17.44■□□□□ 0.38
TTLL3-225ENST00000473661 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP17.34■□□□□ 0.37
TTLL3-225ENST00000473661 ABCC8Q09428 1581 aa17.34■□□□□ 0.37
TTLL3-225ENST00000473661 NESP48681 1621 aa17.32■□□□□ 0.36
TTLL3-225ENST00000473661 PDS5BQ9NTI5 1447 aa17.29■□□□□ 0.36
TTLL3-225ENST00000473661 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa17.29■□□□□ 0.36
TTLL3-225ENST00000473661 FANCD2Q9BXW9 1451 aa17.27■□□□□ 0.36
TTLL3-225ENST00000473661 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP17.27■□□□□ 0.35
TTLL3-225ENST00000473661 CEP164Q9UPV0 1460 aa17.2■□□□□ 0.34
TTLL3-225ENST00000473661 PRDM2Q13029 1718 aa17.17■□□□□ 0.34
TTLL3-225ENST00000473661 ERCC6Q03468 1493 aa17.14■□□□□ 0.33
TTLL3-225ENST00000473661 SYNJ1O43426 1573 aa17.13■□□□□ 0.33
TTLL3-225ENST00000473661 CUX1P39880 1505 aa17.1■□□□□ 0.33
TTLL3-225ENST00000473661 TOP2BQ02880 1626 aa17.09■□□□□ 0.33
TTLL3-225ENST00000473661 EHMT2Q96KQ7 1210 aa17.06■□□□□ 0.32
TTLL3-225ENST00000473661 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa17.03■□□□□ 0.32
TTLL3-225ENST00000473661 SOGA1O94964 1423 aa17.03■□□□□ 0.32
TTLL3-225ENST00000473661 TOPBP1Q92547 1522 aa17.02■□□□□ 0.32
TTLL3-225ENST00000473661 DNMBPQ6XZF7 1577 aa17.02■□□□□ 0.32
TTLL3-225ENST00000473661 EEA1Q15075 1411 aa17.02■□□□□ 0.31
TTLL3-225ENST00000473661 CSRNP3Q8WYN3 585 aa17.02■□□□□ 0.31
TTLL3-225ENST00000473661 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa17.01■□□□□ 0.31
TTLL3-225ENST00000473661 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa17.01■□□□□ 0.31
TTLL3-225ENST00000473661 FGD5Q6ZNL6 1462 aa17.01■□□□□ 0.31
TTLL3-225ENST00000473661 MRC2Q9UBG0 1479 aa17■□□□□ 0.31
TTLL3-225ENST00000473661 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP16.99■□□□□ 0.31
TTLL3-225ENST00000473661 KIF27Q86VH2 1401 aa16.96■□□□□ 0.31
TTLL3-225ENST00000473661 CUX2O14529 1486 aa16.93■□□□□ 0.3
TTLL3-225ENST00000473661 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP16.93■□□□□ 0.3
TTLL3-225ENST00000473661 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa16.93■□□□□ 0.3
TTLL3-225ENST00000473661 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa16.9■□□□□ 0.3
TTLL3-225ENST00000473661 UBTFP17480 764 aaKnown RBP16.89■□□□□ 0.29
TTLL3-225ENST00000473661 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP16.83■□□□□ 0.28
TTLL3-225ENST00000473661 WDR62O43379 1518 aa16.83■□□□□ 0.28
TTLL3-225ENST00000473661 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa16.82■□□□□ 0.28
TTLL3-225ENST00000473661 IFT140Q96RY7 1462 aa16.78■□□□□ 0.28
TTLL3-225ENST00000473661 GOLGA3Q08378 1498 aa16.77■□□□□ 0.27
TTLL3-225ENST00000473661 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP16.76■□□□□ 0.27
TTLL3-225ENST00000473661 IGF1RP08069 1367 aa16.76■□□□□ 0.27
TTLL3-225ENST00000473661 GAPVD1Q14C86 1478 aa16.74■□□□□ 0.27
TTLL3-225ENST00000473661 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa16.74■□□□□ 0.27
TTLL3-225ENST00000473661 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP16.7■□□□□ 0.263e-11■■■■■ 47.8
TTLL3-225ENST00000473661 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP16.7■□□□□ 0.26
TTLL3-225ENST00000473661 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP16.68■□□□□ 0.26
TTLL3-225ENST00000473661 TNIKQ9UKE5 1360 aa16.68■□□□□ 0.26
TTLL3-225ENST00000473661 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa16.68■□□□□ 0.26
TTLL3-225ENST00000473661 PRXQ9BXM0 1461 aa16.67■□□□□ 0.26
TTLL3-225ENST00000473661 KIF21BO75037 1637 aa16.67■□□□□ 0.26
TTLL3-225ENST00000473661 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP16.65■□□□□ 0.26
TTLL3-225ENST00000473661 GRIN2BQ13224 1484 aa16.64■□□□□ 0.25
TTLL3-225ENST00000473661 ERICH3Q5RHP9 1530 aa16.62■□□□□ 0.25
TTLL3-225ENST00000473661 WDR97A6NE52 1622 aa16.62■□□□□ 0.25
TTLL3-225ENST00000473661 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa16.61■□□□□ 0.25
TTLL3-225ENST00000473661 FBLN2P98095 1184 aa16.61■□□□□ 0.25
TTLL3-225ENST00000473661 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP16.58■□□□□ 0.25
TTLL3-225ENST00000473661 CEP162Q5TB80 1403 aa16.57■□□□□ 0.24
TTLL3-225ENST00000473661 CUL7Q14999 1698 aa16.57■□□□□ 0.24
TTLL3-225ENST00000473661 FHAD1B1AJZ9 1412 aa16.56■□□□□ 0.24
TTLL3-225ENST00000473661 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP16.54■□□□□ 0.24
TTLL3-225ENST00000473661 CLIP1P30622 1438 aa16.53■□□□□ 0.24
TTLL3-225ENST00000473661 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa16.52■□□□□ 0.24
TTLL3-225ENST00000473661 PBRM1Q86U86 1689 aa16.5■□□□□ 0.23
TTLL3-225ENST00000473661 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP16.48■□□□□ 0.23
TTLL3-225ENST00000473661 ADAMTS12P58397 1594 aa16.45■□□□□ 0.22
TTLL3-225ENST00000473661 APLP2Q06481 763 aa16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 80.1 ms