Protein–RNA interactions for Protein: Q06432

CACNG1, Voltage-dependent calcium channel gamma-1 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNG1Q06432 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CACNG1Q06432 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
CACNG1Q06432 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
CACNG1Q06432 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
CACNG1Q06432 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CACNG1Q06432 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CACNG1Q06432 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CACNG1Q06432 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CACNG1Q06432 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CACNG1Q06432 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CACNG1Q06432 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CACNG1Q06432 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CACNG1Q06432 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CACNG1Q06432 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CACNG1Q06432 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CACNG1Q06432 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CACNG1Q06432 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CACNG1Q06432 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CACNG1Q06432 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CACNG1Q06432 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CACNG1Q06432 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CACNG1Q06432 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CACNG1Q06432 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CACNG1Q06432 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CACNG1Q06432 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CACNG1Q06432 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CACNG1Q06432 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CACNG1Q06432 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CACNG1Q06432 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CACNG1Q06432 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CACNG1Q06432 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CACNG1Q06432 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CACNG1Q06432 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CACNG1Q06432 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CACNG1Q06432 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CACNG1Q06432 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CACNG1Q06432 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CACNG1Q06432 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CACNG1Q06432 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CACNG1Q06432 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CACNG1Q06432 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CACNG1Q06432 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CACNG1Q06432 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CACNG1Q06432 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CACNG1Q06432 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CACNG1Q06432 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CACNG1Q06432 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CACNG1Q06432 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CACNG1Q06432 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CACNG1Q06432 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CACNG1Q06432 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CACNG1Q06432 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CACNG1Q06432 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CACNG1Q06432 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CACNG1Q06432 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CACNG1Q06432 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CACNG1Q06432 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CACNG1Q06432 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CACNG1Q06432 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CACNG1Q06432 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CACNG1Q06432 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CACNG1Q06432 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CACNG1Q06432 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CACNG1Q06432 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CACNG1Q06432 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CACNG1Q06432 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CACNG1Q06432 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
CACNG1Q06432 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CACNG1Q06432 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CACNG1Q06432 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CACNG1Q06432 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CACNG1Q06432 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CACNG1Q06432 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
CACNG1Q06432 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CACNG1Q06432 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CACNG1Q06432 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CACNG1Q06432 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CACNG1Q06432 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
CACNG1Q06432 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CACNG1Q06432 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CACNG1Q06432 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CACNG1Q06432 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CACNG1Q06432 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CACNG1Q06432 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CACNG1Q06432 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CACNG1Q06432 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CACNG1Q06432 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CACNG1Q06432 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CACNG1Q06432 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CACNG1Q06432 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CACNG1Q06432 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CACNG1Q06432 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CACNG1Q06432 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CACNG1Q06432 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CACNG1Q06432 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CACNG1Q06432 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CACNG1Q06432 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CACNG1Q06432 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CACNG1Q06432 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CACNG1Q06432 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms