Protein–RNA interactions for Protein: Q02641

CACNB1, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB1Q02641 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CACNB1Q02641 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CACNB1Q02641 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CACNB1Q02641 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CACNB1Q02641 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CACNB1Q02641 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CACNB1Q02641 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CACNB1Q02641 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
CACNB1Q02641 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
CACNB1Q02641 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
CACNB1Q02641 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CACNB1Q02641 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CACNB1Q02641 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CACNB1Q02641 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CACNB1Q02641 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CACNB1Q02641 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CACNB1Q02641 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CACNB1Q02641 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CACNB1Q02641 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CACNB1Q02641 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CACNB1Q02641 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CACNB1Q02641 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
CACNB1Q02641 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CACNB1Q02641 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CACNB1Q02641 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CACNB1Q02641 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CACNB1Q02641 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CACNB1Q02641 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CACNB1Q02641 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.12
CACNB1Q02641 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CACNB1Q02641 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CACNB1Q02641 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CACNB1Q02641 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CACNB1Q02641 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CACNB1Q02641 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CACNB1Q02641 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CACNB1Q02641 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CACNB1Q02641 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CACNB1Q02641 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
CACNB1Q02641 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CACNB1Q02641 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CACNB1Q02641 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CACNB1Q02641 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
CACNB1Q02641 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CACNB1Q02641 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CACNB1Q02641 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CACNB1Q02641 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CACNB1Q02641 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CACNB1Q02641 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
CACNB1Q02641 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
CACNB1Q02641 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
CACNB1Q02641 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
CACNB1Q02641 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
CACNB1Q02641 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
CACNB1Q02641 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
CACNB1Q02641 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
CACNB1Q02641 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
CACNB1Q02641 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CACNB1Q02641 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CACNB1Q02641 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
CACNB1Q02641 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
CACNB1Q02641 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
CACNB1Q02641 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CACNB1Q02641 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CACNB1Q02641 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CACNB1Q02641 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CACNB1Q02641 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CACNB1Q02641 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CACNB1Q02641 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CACNB1Q02641 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
CACNB1Q02641 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CACNB1Q02641 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CACNB1Q02641 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CACNB1Q02641 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CACNB1Q02641 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CACNB1Q02641 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CACNB1Q02641 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CACNB1Q02641 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CACNB1Q02641 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
CACNB1Q02641 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CACNB1Q02641 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CACNB1Q02641 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CACNB1Q02641 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CACNB1Q02641 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CACNB1Q02641 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CACNB1Q02641 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CACNB1Q02641 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CACNB1Q02641 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CACNB1Q02641 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CACNB1Q02641 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CACNB1Q02641 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CACNB1Q02641 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CACNB1Q02641 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CACNB1Q02641 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CACNB1Q02641 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CACNB1Q02641 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CACNB1Q02641 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CACNB1Q02641 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CACNB1Q02641 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CACNB1Q02641 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms