Protein–RNA interactions for Protein: Q00604

NDP, Norrin, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDPQ00604 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NDPQ00604 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NDPQ00604 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NDPQ00604 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NDPQ00604 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NDPQ00604 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NDPQ00604 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NDPQ00604 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NDPQ00604 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NDPQ00604 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NDPQ00604 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NDPQ00604 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NDPQ00604 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NDPQ00604 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NDPQ00604 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NDPQ00604 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
NDPQ00604 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NDPQ00604 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NDPQ00604 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NDPQ00604 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NDPQ00604 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NDPQ00604 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NDPQ00604 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NDPQ00604 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
NDPQ00604 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
NDPQ00604 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
NDPQ00604 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NDPQ00604 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NDPQ00604 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NDPQ00604 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NDPQ00604 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NDPQ00604 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NDPQ00604 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NDPQ00604 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NDPQ00604 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
NDPQ00604 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NDPQ00604 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
NDPQ00604 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NDPQ00604 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NDPQ00604 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NDPQ00604 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NDPQ00604 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NDPQ00604 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NDPQ00604 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NDPQ00604 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
NDPQ00604 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NDPQ00604 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
NDPQ00604 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
NDPQ00604 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
NDPQ00604 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
NDPQ00604 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
NDPQ00604 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
NDPQ00604 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
NDPQ00604 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
NDPQ00604 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
NDPQ00604 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
NDPQ00604 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NDPQ00604 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NDPQ00604 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NDPQ00604 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NDPQ00604 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NDPQ00604 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
NDPQ00604 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NDPQ00604 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NDPQ00604 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NDPQ00604 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NDPQ00604 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NDPQ00604 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NDPQ00604 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NDPQ00604 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NDPQ00604 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NDPQ00604 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NDPQ00604 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NDPQ00604 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
NDPQ00604 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NDPQ00604 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NDPQ00604 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NDPQ00604 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NDPQ00604 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NDPQ00604 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NDPQ00604 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NDPQ00604 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NDPQ00604 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NDPQ00604 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NDPQ00604 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NDPQ00604 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NDPQ00604 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NDPQ00604 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NDPQ00604 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NDPQ00604 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NDPQ00604 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NDPQ00604 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NDPQ00604 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
NDPQ00604 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NDPQ00604 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NDPQ00604 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NDPQ00604 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NDPQ00604 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NDPQ00604 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NDPQ00604 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.7 ms