Protein–RNA interactions for Protein: Q00597

FANCC, Fanconi anemia group C protein, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCCQ00597 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
FANCCQ00597 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
FANCCQ00597 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
FANCCQ00597 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
FANCCQ00597 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
FANCCQ00597 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
FANCCQ00597 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
FANCCQ00597 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
FANCCQ00597 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
FANCCQ00597 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
FANCCQ00597 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
FANCCQ00597 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
FANCCQ00597 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
FANCCQ00597 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
FANCCQ00597 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
FANCCQ00597 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
FANCCQ00597 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
FANCCQ00597 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
FANCCQ00597 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
FANCCQ00597 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
FANCCQ00597 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
FANCCQ00597 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
FANCCQ00597 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
FANCCQ00597 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
FANCCQ00597 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
FANCCQ00597 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
FANCCQ00597 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
FANCCQ00597 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
FANCCQ00597 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
FANCCQ00597 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
FANCCQ00597 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
FANCCQ00597 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
FANCCQ00597 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
FANCCQ00597 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
FANCCQ00597 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
FANCCQ00597 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
FANCCQ00597 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
FANCCQ00597 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
FANCCQ00597 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
FANCCQ00597 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
FANCCQ00597 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
FANCCQ00597 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
FANCCQ00597 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
FANCCQ00597 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
FANCCQ00597 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
FANCCQ00597 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
FANCCQ00597 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
FANCCQ00597 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
FANCCQ00597 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
FANCCQ00597 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
FANCCQ00597 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
FANCCQ00597 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
FANCCQ00597 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
FANCCQ00597 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
FANCCQ00597 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
FANCCQ00597 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
FANCCQ00597 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
FANCCQ00597 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
FANCCQ00597 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
FANCCQ00597 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
FANCCQ00597 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
FANCCQ00597 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
FANCCQ00597 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
FANCCQ00597 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
FANCCQ00597 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
FANCCQ00597 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
FANCCQ00597 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
FANCCQ00597 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
FANCCQ00597 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
FANCCQ00597 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
FANCCQ00597 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
FANCCQ00597 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
FANCCQ00597 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
FANCCQ00597 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
FANCCQ00597 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
FANCCQ00597 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
FANCCQ00597 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
FANCCQ00597 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
FANCCQ00597 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
FANCCQ00597 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
FANCCQ00597 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
FANCCQ00597 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
FANCCQ00597 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
FANCCQ00597 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
FANCCQ00597 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
FANCCQ00597 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
FANCCQ00597 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
FANCCQ00597 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
FANCCQ00597 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
FANCCQ00597 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
FANCCQ00597 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
FANCCQ00597 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
FANCCQ00597 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
FANCCQ00597 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
FANCCQ00597 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
FANCCQ00597 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
FANCCQ00597 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
FANCCQ00597 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
FANCCQ00597 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
FANCCQ00597 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55 ms