Protein–RNA interactions for Protein: P60891

PRPS1, Ribose-phosphate pyrophosphokinase 1, humanhuman

Predictions only

Length 318 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPS1P60891 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRPS1P60891 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRPS1P60891 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRPS1P60891 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
PRPS1P60891 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRPS1P60891 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRPS1P60891 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRPS1P60891 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
PRPS1P60891 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRPS1P60891 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRPS1P60891 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRPS1P60891 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRPS1P60891 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
PRPS1P60891 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRPS1P60891 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
PRPS1P60891 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRPS1P60891 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRPS1P60891 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRPS1P60891 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRPS1P60891 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRPS1P60891 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRPS1P60891 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRPS1P60891 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRPS1P60891 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRPS1P60891 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRPS1P60891 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
PRPS1P60891 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
PRPS1P60891 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRPS1P60891 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRPS1P60891 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRPS1P60891 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRPS1P60891 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRPS1P60891 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRPS1P60891 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRPS1P60891 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRPS1P60891 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRPS1P60891 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRPS1P60891 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRPS1P60891 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRPS1P60891 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
PRPS1P60891 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PRPS1P60891 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PRPS1P60891 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PRPS1P60891 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRPS1P60891 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRPS1P60891 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
PRPS1P60891 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRPS1P60891 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRPS1P60891 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRPS1P60891 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRPS1P60891 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
PRPS1P60891 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRPS1P60891 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRPS1P60891 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRPS1P60891 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRPS1P60891 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRPS1P60891 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRPS1P60891 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PRPS1P60891 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRPS1P60891 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRPS1P60891 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRPS1P60891 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRPS1P60891 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRPS1P60891 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRPS1P60891 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRPS1P60891 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRPS1P60891 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRPS1P60891 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRPS1P60891 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRPS1P60891 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRPS1P60891 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRPS1P60891 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
PRPS1P60891 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRPS1P60891 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRPS1P60891 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRPS1P60891 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRPS1P60891 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRPS1P60891 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRPS1P60891 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PRPS1P60891 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRPS1P60891 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRPS1P60891 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRPS1P60891 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRPS1P60891 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRPS1P60891 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRPS1P60891 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRPS1P60891 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRPS1P60891 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRPS1P60891 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRPS1P60891 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRPS1P60891 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRPS1P60891 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRPS1P60891 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PRPS1P60891 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRPS1P60891 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRPS1P60891 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRPS1P60891 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PRPS1P60891 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRPS1P60891 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRPS1P60891 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms