Protein–RNA interactions for Protein: P57740

NUP107, Nuclear pore complex protein Nup107, humanhuman

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP107P57740 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NUP107P57740 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NUP107P57740 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NUP107P57740 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NUP107P57740 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NUP107P57740 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NUP107P57740 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NUP107P57740 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NUP107P57740 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NUP107P57740 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NUP107P57740 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NUP107P57740 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
NUP107P57740 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NUP107P57740 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NUP107P57740 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NUP107P57740 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NUP107P57740 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NUP107P57740 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NUP107P57740 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NUP107P57740 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NUP107P57740 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NUP107P57740 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NUP107P57740 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NUP107P57740 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NUP107P57740 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NUP107P57740 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NUP107P57740 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NUP107P57740 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NUP107P57740 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NUP107P57740 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NUP107P57740 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NUP107P57740 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NUP107P57740 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
NUP107P57740 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NUP107P57740 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NUP107P57740 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NUP107P57740 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NUP107P57740 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NUP107P57740 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NUP107P57740 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NUP107P57740 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NUP107P57740 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NUP107P57740 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
NUP107P57740 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NUP107P57740 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NUP107P57740 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NUP107P57740 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NUP107P57740 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NUP107P57740 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NUP107P57740 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
NUP107P57740 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NUP107P57740 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NUP107P57740 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NUP107P57740 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NUP107P57740 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NUP107P57740 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NUP107P57740 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NUP107P57740 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NUP107P57740 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
NUP107P57740 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NUP107P57740 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NUP107P57740 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NUP107P57740 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NUP107P57740 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
NUP107P57740 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
NUP107P57740 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
NUP107P57740 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NUP107P57740 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NUP107P57740 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NUP107P57740 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NUP107P57740 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NUP107P57740 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NUP107P57740 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NUP107P57740 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NUP107P57740 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NUP107P57740 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NUP107P57740 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NUP107P57740 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NUP107P57740 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NUP107P57740 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NUP107P57740 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NUP107P57740 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NUP107P57740 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NUP107P57740 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NUP107P57740 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
NUP107P57740 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NUP107P57740 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NUP107P57740 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NUP107P57740 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NUP107P57740 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NUP107P57740 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NUP107P57740 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NUP107P57740 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NUP107P57740 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NUP107P57740 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NUP107P57740 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NUP107P57740 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NUP107P57740 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NUP107P57740 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NUP107P57740 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.8 ms