Protein–RNA interactions for Protein: P50876

RNF144A, E3 ubiquitin-protein ligase RNF144A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF144AP50876 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RNF144AP50876 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RNF144AP50876 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RNF144AP50876 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RNF144AP50876 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RNF144AP50876 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
RNF144AP50876 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RNF144AP50876 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RNF144AP50876 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RNF144AP50876 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RNF144AP50876 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RNF144AP50876 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RNF144AP50876 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RNF144AP50876 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RNF144AP50876 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RNF144AP50876 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RNF144AP50876 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RNF144AP50876 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RNF144AP50876 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RNF144AP50876 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RNF144AP50876 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RNF144AP50876 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RNF144AP50876 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RNF144AP50876 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RNF144AP50876 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RNF144AP50876 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RNF144AP50876 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RNF144AP50876 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RNF144AP50876 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RNF144AP50876 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RNF144AP50876 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RNF144AP50876 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RNF144AP50876 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RNF144AP50876 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RNF144AP50876 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RNF144AP50876 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RNF144AP50876 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RNF144AP50876 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RNF144AP50876 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RNF144AP50876 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RNF144AP50876 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RNF144AP50876 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RNF144AP50876 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RNF144AP50876 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RNF144AP50876 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RNF144AP50876 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RNF144AP50876 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RNF144AP50876 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RNF144AP50876 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
RNF144AP50876 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RNF144AP50876 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RNF144AP50876 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RNF144AP50876 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RNF144AP50876 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RNF144AP50876 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RNF144AP50876 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RNF144AP50876 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RNF144AP50876 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RNF144AP50876 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RNF144AP50876 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RNF144AP50876 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RNF144AP50876 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RNF144AP50876 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RNF144AP50876 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RNF144AP50876 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RNF144AP50876 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RNF144AP50876 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RNF144AP50876 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RNF144AP50876 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RNF144AP50876 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RNF144AP50876 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RNF144AP50876 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RNF144AP50876 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RNF144AP50876 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RNF144AP50876 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RNF144AP50876 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RNF144AP50876 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
RNF144AP50876 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RNF144AP50876 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RNF144AP50876 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RNF144AP50876 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
RNF144AP50876 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RNF144AP50876 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
RNF144AP50876 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
RNF144AP50876 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RNF144AP50876 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
RNF144AP50876 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RNF144AP50876 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RNF144AP50876 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RNF144AP50876 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RNF144AP50876 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RNF144AP50876 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RNF144AP50876 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RNF144AP50876 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RNF144AP50876 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RNF144AP50876 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RNF144AP50876 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RNF144AP50876 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RNF144AP50876 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RNF144AP50876 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 312 ms