Protein–RNA interactions for Protein: P49368

CCT3, T-complex protein 1 subunit gamma, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCT3P49368 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCT3P49368 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCT3P49368 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCT3P49368 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
CCT3P49368 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCT3P49368 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCT3P49368 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCT3P49368 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCT3P49368 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCT3P49368 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCT3P49368 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
CCT3P49368 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCT3P49368 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCT3P49368 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCT3P49368 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCT3P49368 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCT3P49368 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCT3P49368 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCT3P49368 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCT3P49368 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCT3P49368 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCT3P49368 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCT3P49368 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCT3P49368 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCT3P49368 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCT3P49368 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCT3P49368 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCT3P49368 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCT3P49368 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCT3P49368 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCT3P49368 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCT3P49368 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCT3P49368 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCT3P49368 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCT3P49368 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCT3P49368 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCT3P49368 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCT3P49368 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCT3P49368 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCT3P49368 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCT3P49368 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
CCT3P49368 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCT3P49368 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCT3P49368 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCT3P49368 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCT3P49368 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCT3P49368 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCT3P49368 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCT3P49368 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCT3P49368 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCT3P49368 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCT3P49368 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCT3P49368 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCT3P49368 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCT3P49368 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCT3P49368 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCT3P49368 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCT3P49368 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCT3P49368 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCT3P49368 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCT3P49368 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCT3P49368 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CCT3P49368 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CCT3P49368 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCT3P49368 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCT3P49368 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCT3P49368 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCT3P49368 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCT3P49368 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCT3P49368 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCT3P49368 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CCT3P49368 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCT3P49368 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCT3P49368 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCT3P49368 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCT3P49368 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCT3P49368 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CCT3P49368 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCT3P49368 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCT3P49368 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCT3P49368 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCT3P49368 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCT3P49368 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCT3P49368 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCT3P49368 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCT3P49368 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCT3P49368 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCT3P49368 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCT3P49368 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCT3P49368 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCT3P49368 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCT3P49368 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCT3P49368 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCT3P49368 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCT3P49368 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCT3P49368 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCT3P49368 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCT3P49368 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CCT3P49368 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CCT3P49368 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms