Protein–RNA interactions for Protein: P35125

USP6, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP6P35125 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.06■■■■□ 3.2
USP6P35125 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
USP6P35125 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
USP6P35125 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
USP6P35125 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
USP6P35125 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC35.02■■■■□ 3.2
USP6P35125 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC35.02■■■■□ 3.2
USP6P35125 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC35.02■■■■□ 3.2
USP6P35125 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
USP6P35125 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
USP6P35125 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.19
USP6P35125 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.01■■■■□ 3.19
USP6P35125 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC35■■■■□ 3.19
USP6P35125 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC35■■■■□ 3.19
USP6P35125 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
USP6P35125 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35■■■■□ 3.19
USP6P35125 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
USP6P35125 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC34.99■■■■□ 3.19
USP6P35125 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC34.99■■■■□ 3.19
USP6P35125 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
USP6P35125 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
USP6P35125 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
USP6P35125 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC34.98■■■■□ 3.19
USP6P35125 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC34.98■■■■□ 3.19
USP6P35125 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
USP6P35125 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
USP6P35125 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
USP6P35125 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
USP6P35125 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC34.97■■■■□ 3.19
USP6P35125 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
USP6P35125 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
USP6P35125 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.95■■■■□ 3.19
USP6P35125 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC34.95■■■■□ 3.19
USP6P35125 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC34.94■■■■□ 3.18
USP6P35125 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
USP6P35125 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC34.93■■■■□ 3.18
USP6P35125 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
USP6P35125 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
USP6P35125 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
USP6P35125 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
USP6P35125 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC34.91■■■■□ 3.18
USP6P35125 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
USP6P35125 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
USP6P35125 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC34.91■■■■□ 3.18
USP6P35125 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC34.9■■■■□ 3.18
USP6P35125 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC34.9■■■■□ 3.18
USP6P35125 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
USP6P35125 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC34.9■■■■□ 3.18
USP6P35125 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
USP6P35125 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
USP6P35125 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
USP6P35125 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC34.89■■■■□ 3.18
USP6P35125 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC34.88■■■■□ 3.17
USP6P35125 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
USP6P35125 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
USP6P35125 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC34.87■■■■□ 3.17
USP6P35125 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC34.87■■■■□ 3.17
USP6P35125 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.86■■■■□ 3.17
USP6P35125 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC34.86■■■■□ 3.17
USP6P35125 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
USP6P35125 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC34.85■■■■□ 3.17
USP6P35125 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
USP6P35125 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
USP6P35125 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC34.83■■■■□ 3.17
USP6P35125 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
USP6P35125 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
USP6P35125 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.81■■■■□ 3.16
USP6P35125 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC34.81■■■■□ 3.16
USP6P35125 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC34.8■■■■□ 3.16
USP6P35125 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.8■■■■□ 3.16
USP6P35125 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC34.8■■■■□ 3.16
USP6P35125 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
USP6P35125 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
USP6P35125 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
USP6P35125 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
USP6P35125 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC34.79■■■■□ 3.16
USP6P35125 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
USP6P35125 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC34.79■■■■□ 3.16
USP6P35125 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
USP6P35125 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC34.78■■■■□ 3.16
USP6P35125 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
USP6P35125 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
USP6P35125 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC34.77■■■■□ 3.16
USP6P35125 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC34.76■■■■□ 3.16
USP6P35125 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC34.76■■■■□ 3.16
USP6P35125 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
USP6P35125 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
USP6P35125 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC34.74■■■■□ 3.15
USP6P35125 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC34.74■■■■□ 3.15
USP6P35125 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
USP6P35125 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
USP6P35125 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC34.72■■■■□ 3.15
USP6P35125 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC34.71■■■■□ 3.15
USP6P35125 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
USP6P35125 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC34.71■■■■□ 3.15
USP6P35125 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
USP6P35125 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
USP6P35125 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.69■■■■□ 3.14
USP6P35125 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC34.69■■■■□ 3.14
USP6P35125 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC34.69■■■■□ 3.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.9 ms