Protein–RNA interactions for Protein: P34741

SDC2, Syndecan-2, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDC2P34741 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SDC2P34741 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SDC2P34741 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SDC2P34741 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SDC2P34741 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SDC2P34741 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SDC2P34741 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SDC2P34741 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SDC2P34741 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SDC2P34741 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SDC2P34741 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SDC2P34741 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SDC2P34741 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SDC2P34741 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SDC2P34741 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SDC2P34741 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SDC2P34741 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SDC2P34741 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SDC2P34741 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SDC2P34741 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SDC2P34741 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SDC2P34741 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SDC2P34741 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SDC2P34741 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SDC2P34741 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SDC2P34741 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SDC2P34741 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SDC2P34741 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SDC2P34741 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SDC2P34741 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SDC2P34741 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SDC2P34741 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SDC2P34741 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SDC2P34741 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SDC2P34741 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SDC2P34741 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SDC2P34741 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SDC2P34741 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SDC2P34741 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SDC2P34741 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SDC2P34741 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SDC2P34741 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SDC2P34741 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SDC2P34741 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SDC2P34741 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SDC2P34741 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SDC2P34741 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SDC2P34741 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SDC2P34741 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SDC2P34741 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SDC2P34741 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SDC2P34741 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SDC2P34741 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SDC2P34741 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SDC2P34741 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SDC2P34741 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SDC2P34741 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SDC2P34741 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SDC2P34741 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SDC2P34741 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SDC2P34741 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SDC2P34741 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SDC2P34741 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SDC2P34741 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SDC2P34741 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SDC2P34741 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SDC2P34741 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SDC2P34741 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SDC2P34741 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SDC2P34741 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SDC2P34741 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SDC2P34741 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SDC2P34741 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SDC2P34741 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SDC2P34741 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SDC2P34741 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SDC2P34741 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SDC2P34741 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SDC2P34741 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SDC2P34741 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SDC2P34741 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SDC2P34741 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SDC2P34741 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SDC2P34741 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SDC2P34741 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SDC2P34741 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SDC2P34741 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SDC2P34741 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SDC2P34741 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SDC2P34741 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SDC2P34741 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SDC2P34741 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SDC2P34741 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SDC2P34741 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SDC2P34741 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
SDC2P34741 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SDC2P34741 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SDC2P34741 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SDC2P34741 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SDC2P34741 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms