Protein–RNA interactions for Protein: P33240

CSTF2, Cleavage stimulation factor subunit 2, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 577 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTF2P33240 PPARG-214ENST00000497594 1600 ntTSL 1 (best)9.28□□□□□ -0.922e-6■■■■■ 30.1
CSTF2P33240 PPARG-207ENST00000397015 1722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.062e-6■■■■■ 30.1
CSTF2P33240 PPARG-209ENST00000397026 2029 ntTSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.092e-6■■■■■ 30.1
CSTF2P33240 PPARG-204ENST00000397000 1122 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.392e-6■■■■■ 30.1
CSTF2P33240 PPARG-211ENST00000438682 560 ntTSL 34.93□□□□□ -1.622e-6■■■■■ 30.1
CSTF2P33240 RCC1-210ENST00000434290 1070 ntTSL 512.88□□□□□ -0.351e-6■■■■■ 30.1
CSTF2P33240 RCC1-207ENST00000427469 903 ntTSL 512.84□□□□□ -0.351e-6■■■■■ 30.1
CSTF2P33240 RCC1-204ENST00000398958 2715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71e-6■■■■■ 30.1
CSTF2P33240 RCC1-203ENST00000373833 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.851e-6■■■■■ 30.1
CSTF2P33240 SPATS2L-225ENST00000471533 329 ntTSL 319.3■□□□□ 0.685e-7■■■■■ 30.1
CSTF2P33240 SPATS2L-221ENST00000459656 1901 ntTSL 1 (best)19.19■□□□□ 0.665e-7■■■■■ 30.1
CSTF2P33240 SPATS2L-216ENST00000444012 605 ntTSL 418.31■□□□□ 0.525e-7■■■■■ 30.1
CSTF2P33240 SPATS2L-212ENST00000428692 541 ntTSL 417.89■□□□□ 0.455e-7■■■■■ 30.1
CSTF2P33240 SPATS2L-220ENST00000457757 835 ntTSL 517.89■□□□□ 0.455e-7■■■■■ 30.1
CSTF2P33240 SPATS2L-211ENST00000423749 771 ntTSL 517.65■□□□□ 0.425e-7■■■■■ 30.1
CSTF2P33240 SPATS2L-226ENST00000471601 1730 ntTSL 213.84□□□□□ -0.195e-7■■■■■ 30.1
CSTF2P33240 SPATS2L-214ENST00000439084 584 ntTSL 313.74□□□□□ -0.215e-7■■■■■ 30.1
CSTF2P33240 SPATS2L-219ENST00000453663 637 ntTSL 410.03□□□□□ -0.85e-7■■■■■ 30.1
CSTF2P33240 SPATS2L-215ENST00000439395 561 ntTSL 45.23□□□□□ -1.575e-7■■■■■ 30.1
CSTF2P33240 N4BP2L1-206ENST00000464470 1145 ntTSL 215.49■□□□□ 0.077e-11■■■■■ 30
CSTF2P33240 EEF1A1-201ENST00000309268 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.697e-11■■■■■ 30
CSTF2P33240 EEF1A1-208ENST00000491404 633 ntTSL 34.55□□□□□ -1.687e-11■■■■■ 30
CSTF2P33240 ARHGAP12-203ENST00000375245 4958 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.55e-10■■■■■ 30
CSTF2P33240 ARHGAP12-205ENST00000396144 5084 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.575e-10■■■■■ 30
CSTF2P33240 ARHGAP12-202ENST00000344936 4128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.765e-10■■■■■ 30
CSTF2P33240 ARHGAP12-204ENST00000375250 4914 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.35e-10■■■■■ 30
CSTF2P33240 ARHGAP12-201ENST00000311380 4625 ntTSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.885e-10■■■■■ 30
CSTF2P33240 FOXN3-211ENST00000555855 851 ntTSL 519.44■□□□□ 0.71e-8■■■■■ 30
CSTF2P33240 AL137230.2-201ENST00000555070 452 ntTSL 3 BASIC8.49□□□□□ -1.051e-8■■■■■ 30
CSTF2P33240 PDE3B-205ENST00000534317 5521 ntTSL 1 (best)18.25■□□□□ 0.512e-7■■■■■ 29.9
CSTF2P33240 SMAD5-208ENST00000513418 523 ntTSL 52.54□□□□□ -24e-10■■■■■ 29.9
CSTF2P33240 AIG1-204ENST00000367601 727 ntTSL 512.52□□□□□ -0.416e-13■■■■■ 29.9
CSTF2P33240 AIG1-205ENST00000447498 444 ntTSL 511.97□□□□□ -0.496e-13■■■■■ 29.9
CSTF2P33240 AIG1-202ENST00000357847 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.916e-13■■■■■ 29.9
CSTF2P33240 AIG1-201ENST00000275235 1202 ntTSL 2 BASIC8.51□□□□□ -1.056e-13■■■■■ 29.9
CSTF2P33240 AIG1-209ENST00000629020 3636 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.256e-13■■■■■ 29.9
CSTF2P33240 AIG1-208ENST00000494282 3393 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.516e-13■■■■■ 29.9
CSTF2P33240 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.014e-10■■■■■ 29.9
CSTF2P33240 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.567e-9■■■■■ 29.8
CSTF2P33240 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.017e-9■■■■■ 29.8
CSTF2P33240 AC006504.5-209ENST00000591549 500 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.747e-9■■■■■ 29.8
CSTF2P33240 AC006504.5-206ENST00000585917 719 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.87e-9■■■■■ 29.8
CSTF2P33240 AC006504.5-212ENST00000587188 746 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.547e-9■■■■■ 29.8
CSTF2P33240 AC006504.7-201ENST00000592806 924 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.547e-9■■■■■ 29.8
CSTF2P33240 AC006504.5-201ENST00000588122 655 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.597e-9■■■■■ 29.8
CSTF2P33240 AC006504.5-202ENST00000586784 656 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.67e-9■■■■■ 29.8
CSTF2P33240 AC006504.5-204ENST00000592404 765 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.067e-9■■■■■ 29.8
CSTF2P33240 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.256e-11■■■■■ 29.8
CSTF2P33240 CNST-204ENST00000483271 2767 ntTSL 215.23■□□□□ 0.036e-11■■■■■ 29.8
CSTF2P33240 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.036e-11■■■■■ 29.8
CSTF2P33240 CNST-201ENST00000366511 645 ntTSL 3 BASIC9.38□□□□□ -0.916e-11■■■■■ 29.8
CSTF2P33240 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.9■■■□□ 2.78e-7■■■■■ 29.8
CSTF2P33240 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.268e-7■■■■■ 29.8
CSTF2P33240 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.018e-7■■■■■ 29.8
CSTF2P33240 CSNK1E-208ENST00000431611 814 ntTSL 515.06■□□□□ 08e-7■■■■■ 29.8
CSTF2P33240 CSNK1E-209ENST00000431632 763 ntTSL 213.92□□□□□ -0.188e-7■■■■■ 29.8
CSTF2P33240 CSNK1E-201ENST00000359867 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.368e-7■■■■■ 29.8
CSTF2P33240 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.024e-7■■■■■ 29.7
CSTF2P33240 TJP2-206ENST00000453658 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.384e-7■■■■■ 29.7
CSTF2P33240 PCM1-201ENST00000325083 6820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.28e-7■■■■■ 29.7
CSTF2P33240 PCM1-202ENST00000327578 8287 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.248e-7■■■■■ 29.7
CSTF2P33240 PCM1-212ENST00000519253 6443 ntTSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.098e-7■■■■■ 29.7
CSTF2P33240 PCM1-215ENST00000522275 2379 ntTSL 24.89□□□□□ -1.638e-7■■■■■ 29.7
CSTF2P33240 PCM1-222ENST00000524226 5955 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -28e-7■■■■■ 29.7
CSTF2P33240 PMM2-214ENST00000567697 5409 ntTSL 1 (best)11.86□□□□□ -0.512e-10■■■■■ 29.7
CSTF2P33240 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.33e-10■■■■■ 29.7
CSTF2P33240 HSPE1-MOB4-201ENST00000604458 890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.733e-10■■■■■ 29.7
CSTF2P33240 ALG11-203ENST00000523764 1404 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.285e-9■■■■■ 29.7
CSTF2P33240 ALG11-204ENST00000616513 1983 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.375e-9■■■■■ 29.7
CSTF2P33240 ALG11-202ENST00000521508 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.415e-9■■■■■ 29.7
CSTF2P33240 GMDS-AS1-216ENST00000607519 579 ntTSL 410.06□□□□□ -0.81e-7■■■■■ 29.6
CSTF2P33240 PDCD2-201ENST00000167218 1118 ntTSL 527.54■■■□□ 23e-10■■■■■ 29.5
CSTF2P33240 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.733e-10■■■■■ 29.5
CSTF2P33240 PDCD2-214ENST00000545869 900 ntTSL 523.32■■□□□ 1.323e-10■■■■■ 29.5
CSTF2P33240 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.673e-10■■■■■ 29.5
CSTF2P33240 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.613e-10■■■■■ 29.5
CSTF2P33240 PDCD2-207ENST00000539212 445 ntTSL 317.1■□□□□ 0.333e-10■■■■■ 29.5
CSTF2P33240 PDCD2-213ENST00000544866 710 ntTSL 516.32■□□□□ 0.23e-10■■■■■ 29.5
CSTF2P33240 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.153e-10■■■■■ 29.5
CSTF2P33240 PDCD2-206ENST00000538195 560 ntTSL 56.07□□□□□ -1.443e-10■■■■■ 29.5
CSTF2P33240 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.91e-6■■■■■ 29.5
CSTF2P33240 SPAG9-211ENST00000511312 943 ntTSL 213.94□□□□□ -0.187e-7■■■■■ 29.5
CSTF2P33240 PLCB1-226ENST00000636784 100 ntTSL 53.36□□□□□ -1.879e-7■■■■■ 29.4
CSTF2P33240 KIAA1958-201ENST00000337530 11775 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.992e-6■■■■■ 29.4
CSTF2P33240 KIAA1958-203ENST00000536272 7650 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.252e-6■■■■■ 29.4
CSTF2P33240 AL136531.2-201ENST00000618770 1164 ntTSL 218.05■□□□□ 0.481e-10■■■■■ 29.4
CSTF2P33240 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.65■□□□□ 0.11e-10■■■■■ 29.4
CSTF2P33240 OSER1-201ENST00000255174 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.181e-10■■■■■ 29.4
CSTF2P33240 OSER1-202ENST00000372970 1616 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.24□□□□□ -1.091e-10■■■■■ 29.4
CSTF2P33240 TBCK-220ENST00000515705 592 ntTSL 58.87□□□□□ -0.994e-10■■■■■ 29.4
CSTF2P33240 TBCK-219ENST00000514689 703 ntTSL 35□□□□□ -1.614e-10■■■■■ 29.4
CSTF2P33240 IWS1-201ENST00000295321 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.383e-10■■■■■ 29.4
CSTF2P33240 PLCB1-218ENST00000629992 3095 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.286e-7■■■■■ 29.4
CSTF2P33240 TM2D1-211ENST00000496465 577 ntTSL 217.97■□□□□ 0.472e-8■■■■■ 29.3
CSTF2P33240 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.32e-8■■■■■ 29.3
CSTF2P33240 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.32e-8■■■■■ 29.3
CSTF2P33240 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.32e-8■■■■■ 29.3
CSTF2P33240 TM2D1-208ENST00000488206 921 ntTSL 515.07■□□□□ 02e-8■■■■■ 29.3
CSTF2P33240 TM2D1-203ENST00000371178 1056 ntTSL 513.97□□□□□ -0.172e-8■■■■■ 29.3
CSTF2P33240 TM2D1-210ENST00000494926 544 ntTSL 511.4□□□□□ -0.582e-8■■■■■ 29.3
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