Protein–RNA interactions for Protein: P32239

CCKBR, Gastrin/cholecystokinin type B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCKBRP32239 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCKBRP32239 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CCKBRP32239 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCKBRP32239 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCKBRP32239 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCKBRP32239 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCKBRP32239 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCKBRP32239 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCKBRP32239 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCKBRP32239 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCKBRP32239 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCKBRP32239 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCKBRP32239 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCKBRP32239 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCKBRP32239 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCKBRP32239 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCKBRP32239 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCKBRP32239 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCKBRP32239 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCKBRP32239 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CCKBRP32239 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCKBRP32239 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCKBRP32239 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCKBRP32239 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCKBRP32239 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCKBRP32239 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCKBRP32239 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CCKBRP32239 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCKBRP32239 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCKBRP32239 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
CCKBRP32239 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCKBRP32239 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CCKBRP32239 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCKBRP32239 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCKBRP32239 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCKBRP32239 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCKBRP32239 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCKBRP32239 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCKBRP32239 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCKBRP32239 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCKBRP32239 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCKBRP32239 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCKBRP32239 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCKBRP32239 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCKBRP32239 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCKBRP32239 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CCKBRP32239 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCKBRP32239 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCKBRP32239 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCKBRP32239 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCKBRP32239 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCKBRP32239 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCKBRP32239 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CCKBRP32239 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCKBRP32239 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCKBRP32239 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCKBRP32239 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCKBRP32239 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCKBRP32239 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCKBRP32239 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCKBRP32239 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCKBRP32239 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCKBRP32239 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCKBRP32239 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCKBRP32239 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCKBRP32239 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCKBRP32239 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCKBRP32239 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCKBRP32239 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCKBRP32239 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CCKBRP32239 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCKBRP32239 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCKBRP32239 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCKBRP32239 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CCKBRP32239 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCKBRP32239 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCKBRP32239 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCKBRP32239 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCKBRP32239 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCKBRP32239 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCKBRP32239 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.48
CCKBRP32239 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCKBRP32239 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CCKBRP32239 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCKBRP32239 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCKBRP32239 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCKBRP32239 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CCKBRP32239 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCKBRP32239 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCKBRP32239 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCKBRP32239 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCKBRP32239 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCKBRP32239 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCKBRP32239 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCKBRP32239 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCKBRP32239 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCKBRP32239 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCKBRP32239 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCKBRP32239 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCKBRP32239 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms