Protein–RNA interactions for Protein: P31277

HOXD11, Homeobox protein Hox-D11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD11P31277 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
HOXD11P31277 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
HOXD11P31277 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
HOXD11P31277 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
HOXD11P31277 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
HOXD11P31277 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
HOXD11P31277 EIF2S2P5-201ENST00000457635 968 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
HOXD11P31277 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
HOXD11P31277 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
HOXD11P31277 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
HOXD11P31277 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC26.15■■□□□ 1.78
HOXD11P31277 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
HOXD11P31277 AC090572.2-201ENST00000520649 761 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
HOXD11P31277 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
HOXD11P31277 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
HOXD11P31277 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
HOXD11P31277 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
HOXD11P31277 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
HOXD11P31277 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
HOXD11P31277 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
HOXD11P31277 C4orf45-201ENST00000434826 1215 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
HOXD11P31277 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC26.12■■□□□ 1.77
HOXD11P31277 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
HOXD11P31277 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
HOXD11P31277 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
HOXD11P31277 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
HOXD11P31277 AL031670.1-201ENST00000619343 669 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
HOXD11P31277 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
HOXD11P31277 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
HOXD11P31277 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
HOXD11P31277 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
HOXD11P31277 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
HOXD11P31277 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
HOXD11P31277 Z97985.1-201ENST00000332270 946 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
HOXD11P31277 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
HOXD11P31277 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
HOXD11P31277 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
HOXD11P31277 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
HOXD11P31277 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
HOXD11P31277 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
HOXD11P31277 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
HOXD11P31277 AL158211.2-201ENST00000607282 395 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
HOXD11P31277 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
HOXD11P31277 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
HOXD11P31277 CCL8-201ENST00000394620 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
HOXD11P31277 OR13I1P-201ENST00000609811 1264 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
HOXD11P31277 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
HOXD11P31277 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
HOXD11P31277 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
HOXD11P31277 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
HOXD11P31277 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
HOXD11P31277 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
HOXD11P31277 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
HOXD11P31277 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
HOXD11P31277 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
HOXD11P31277 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
HOXD11P31277 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
HOXD11P31277 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
HOXD11P31277 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
HOXD11P31277 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
HOXD11P31277 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
HOXD11P31277 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
HOXD11P31277 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
HOXD11P31277 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
HOXD11P31277 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
HOXD11P31277 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
HOXD11P31277 AL139317.3-201ENST00000555969 898 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
HOXD11P31277 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
HOXD11P31277 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
HOXD11P31277 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
HOXD11P31277 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
HOXD11P31277 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
HOXD11P31277 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
HOXD11P31277 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
HOXD11P31277 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
HOXD11P31277 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
HOXD11P31277 LINC01431-201ENST00000442440 514 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
HOXD11P31277 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
HOXD11P31277 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
HOXD11P31277 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
HOXD11P31277 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
HOXD11P31277 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
HOXD11P31277 AC066613.1-202ENST00000560727 630 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
HOXD11P31277 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
HOXD11P31277 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
HOXD11P31277 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
HOXD11P31277 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
HOXD11P31277 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
HOXD11P31277 AL365223.1-201ENST00000574864 1297 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
HOXD11P31277 AL391001.1-201ENST00000602747 715 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
HOXD11P31277 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
HOXD11P31277 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
HOXD11P31277 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
HOXD11P31277 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
HOXD11P31277 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
HOXD11P31277 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
HOXD11P31277 GOSR1-204ENST00000451249 1231 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
HOXD11P31277 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC25.93■■□□□ 1.74
HOXD11P31277 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
HOXD11P31277 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms