Protein–RNA interactions for Protein: P29965

CD40LG, CD40 ligand, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD40LGP29965 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CD40LGP29965 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CD40LGP29965 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CD40LGP29965 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CD40LGP29965 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CD40LGP29965 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CD40LGP29965 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CD40LGP29965 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CD40LGP29965 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CD40LGP29965 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CD40LGP29965 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CD40LGP29965 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CD40LGP29965 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CD40LGP29965 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CD40LGP29965 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CD40LGP29965 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CD40LGP29965 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CD40LGP29965 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CD40LGP29965 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CD40LGP29965 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
CD40LGP29965 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CD40LGP29965 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CD40LGP29965 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CD40LGP29965 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CD40LGP29965 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CD40LGP29965 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CD40LGP29965 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CD40LGP29965 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CD40LGP29965 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CD40LGP29965 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CD40LGP29965 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CD40LGP29965 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CD40LGP29965 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CD40LGP29965 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CD40LGP29965 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CD40LGP29965 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CD40LGP29965 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CD40LGP29965 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CD40LGP29965 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CD40LGP29965 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CD40LGP29965 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CD40LGP29965 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CD40LGP29965 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CD40LGP29965 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CD40LGP29965 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CD40LGP29965 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CD40LGP29965 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CD40LGP29965 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CD40LGP29965 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CD40LGP29965 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CD40LGP29965 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CD40LGP29965 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CD40LGP29965 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CD40LGP29965 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CD40LGP29965 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CD40LGP29965 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CD40LGP29965 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CD40LGP29965 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CD40LGP29965 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CD40LGP29965 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CD40LGP29965 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CD40LGP29965 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CD40LGP29965 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CD40LGP29965 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CD40LGP29965 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CD40LGP29965 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CD40LGP29965 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CD40LGP29965 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CD40LGP29965 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CD40LGP29965 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CD40LGP29965 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CD40LGP29965 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CD40LGP29965 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CD40LGP29965 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CD40LGP29965 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CD40LGP29965 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CD40LGP29965 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CD40LGP29965 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CD40LGP29965 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CD40LGP29965 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CD40LGP29965 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CD40LGP29965 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CD40LGP29965 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CD40LGP29965 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CD40LGP29965 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CD40LGP29965 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CD40LGP29965 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CD40LGP29965 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CD40LGP29965 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CD40LGP29965 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CD40LGP29965 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CD40LGP29965 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CD40LGP29965 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CD40LGP29965 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CD40LGP29965 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CD40LGP29965 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CD40LGP29965 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CD40LGP29965 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CD40LGP29965 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CD40LGP29965 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.6 ms