Protein–RNA interactions for Protein: P29536

LMOD1, Leiomodin-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 600 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMOD1P29536 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
LMOD1P29536 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.16■■■□□ 2.58
LMOD1P29536 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.16■■■□□ 2.58
LMOD1P29536 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.16■■■□□ 2.58
LMOD1P29536 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC31.16■■■□□ 2.58
LMOD1P29536 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
LMOD1P29536 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC31.15■■■□□ 2.58
LMOD1P29536 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
LMOD1P29536 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
LMOD1P29536 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
LMOD1P29536 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
LMOD1P29536 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
LMOD1P29536 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC31.13■■■□□ 2.57
LMOD1P29536 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC31.13■■■□□ 2.57
LMOD1P29536 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC31.13■■■□□ 2.57
LMOD1P29536 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
LMOD1P29536 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC31.13■■■□□ 2.57
LMOD1P29536 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC31.12■■■□□ 2.57
LMOD1P29536 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
LMOD1P29536 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC31.12■■■□□ 2.57
LMOD1P29536 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
LMOD1P29536 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
LMOD1P29536 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC31.11■■■□□ 2.57
LMOD1P29536 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC31.11■■■□□ 2.57
LMOD1P29536 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
LMOD1P29536 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
LMOD1P29536 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.09■■■□□ 2.57
LMOD1P29536 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
LMOD1P29536 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC31.08■■■□□ 2.57
LMOD1P29536 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
LMOD1P29536 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.07■■■□□ 2.56
LMOD1P29536 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
LMOD1P29536 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
LMOD1P29536 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
LMOD1P29536 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
LMOD1P29536 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
LMOD1P29536 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
LMOD1P29536 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC31.04■■■□□ 2.56
LMOD1P29536 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC31.04■■■□□ 2.56
LMOD1P29536 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
LMOD1P29536 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC31.04■■■□□ 2.56
LMOD1P29536 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC31.04■■■□□ 2.56
LMOD1P29536 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
LMOD1P29536 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC31.03■■■□□ 2.56
LMOD1P29536 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC31.03■■■□□ 2.56
LMOD1P29536 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
LMOD1P29536 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
LMOD1P29536 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
LMOD1P29536 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
LMOD1P29536 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
LMOD1P29536 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
LMOD1P29536 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
LMOD1P29536 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC31.01■■■□□ 2.55
LMOD1P29536 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
LMOD1P29536 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.55
LMOD1P29536 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
LMOD1P29536 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
LMOD1P29536 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
LMOD1P29536 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
LMOD1P29536 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
LMOD1P29536 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
LMOD1P29536 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
LMOD1P29536 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
LMOD1P29536 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
LMOD1P29536 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC30.98■■■□□ 2.55
LMOD1P29536 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
LMOD1P29536 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
LMOD1P29536 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
LMOD1P29536 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC30.98■■■□□ 2.55
LMOD1P29536 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
LMOD1P29536 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
LMOD1P29536 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
LMOD1P29536 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
LMOD1P29536 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC30.96■■■□□ 2.55
LMOD1P29536 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC30.95■■■□□ 2.54
LMOD1P29536 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
LMOD1P29536 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
LMOD1P29536 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
LMOD1P29536 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
LMOD1P29536 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC30.94■■■□□ 2.54
LMOD1P29536 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC30.92■■■□□ 2.54
LMOD1P29536 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
LMOD1P29536 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC30.91■■■□□ 2.54
LMOD1P29536 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
LMOD1P29536 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
LMOD1P29536 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
LMOD1P29536 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
LMOD1P29536 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC30.89■■■□□ 2.54
LMOD1P29536 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
LMOD1P29536 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
LMOD1P29536 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
LMOD1P29536 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
LMOD1P29536 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.88■■■□□ 2.53
LMOD1P29536 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
LMOD1P29536 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
LMOD1P29536 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
LMOD1P29536 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
LMOD1P29536 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
LMOD1P29536 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
LMOD1P29536 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC30.86■■■□□ 2.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms