Protein–RNA interactions for Protein: P26441

CNTF, Ciliary neurotrophic factor, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTFP26441 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CNTFP26441 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CNTFP26441 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CNTFP26441 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CNTFP26441 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CNTFP26441 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CNTFP26441 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CNTFP26441 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CNTFP26441 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CNTFP26441 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CNTFP26441 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CNTFP26441 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CNTFP26441 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CNTFP26441 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CNTFP26441 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CNTFP26441 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CNTFP26441 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
CNTFP26441 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CNTFP26441 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
CNTFP26441 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CNTFP26441 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CNTFP26441 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CNTFP26441 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CNTFP26441 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CNTFP26441 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CNTFP26441 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CNTFP26441 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CNTFP26441 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CNTFP26441 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CNTFP26441 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CNTFP26441 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CNTFP26441 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CNTFP26441 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CNTFP26441 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CNTFP26441 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CNTFP26441 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CNTFP26441 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CNTFP26441 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CNTFP26441 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CNTFP26441 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CNTFP26441 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CNTFP26441 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CNTFP26441 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CNTFP26441 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CNTFP26441 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CNTFP26441 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CNTFP26441 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CNTFP26441 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CNTFP26441 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CNTFP26441 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CNTFP26441 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CNTFP26441 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CNTFP26441 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CNTFP26441 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CNTFP26441 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CNTFP26441 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CNTFP26441 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CNTFP26441 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CNTFP26441 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CNTFP26441 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CNTFP26441 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
CNTFP26441 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CNTFP26441 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CNTFP26441 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CNTFP26441 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CNTFP26441 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CNTFP26441 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CNTFP26441 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CNTFP26441 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CNTFP26441 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CNTFP26441 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CNTFP26441 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CNTFP26441 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CNTFP26441 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CNTFP26441 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CNTFP26441 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CNTFP26441 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CNTFP26441 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CNTFP26441 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CNTFP26441 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CNTFP26441 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CNTFP26441 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CNTFP26441 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CNTFP26441 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CNTFP26441 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CNTFP26441 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CNTFP26441 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CNTFP26441 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
CNTFP26441 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CNTFP26441 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
CNTFP26441 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CNTFP26441 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CNTFP26441 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CNTFP26441 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CNTFP26441 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CNTFP26441 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CNTFP26441 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CNTFP26441 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CNTFP26441 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CNTFP26441 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms