Protein–RNA interactions for Protein: P24941

CDK2, Cyclin-dependent kinase 2, humanhuman

Predictions only

Length 298 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK2P24941 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDK2P24941 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDK2P24941 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDK2P24941 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDK2P24941 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDK2P24941 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDK2P24941 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDK2P24941 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDK2P24941 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDK2P24941 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDK2P24941 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDK2P24941 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDK2P24941 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDK2P24941 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDK2P24941 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CDK2P24941 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CDK2P24941 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CDK2P24941 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CDK2P24941 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CDK2P24941 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CDK2P24941 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CDK2P24941 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CDK2P24941 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CDK2P24941 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CDK2P24941 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CDK2P24941 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CDK2P24941 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CDK2P24941 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CDK2P24941 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CDK2P24941 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CDK2P24941 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CDK2P24941 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CDK2P24941 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
CDK2P24941 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CDK2P24941 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CDK2P24941 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CDK2P24941 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CDK2P24941 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CDK2P24941 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CDK2P24941 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CDK2P24941 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDK2P24941 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDK2P24941 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDK2P24941 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDK2P24941 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDK2P24941 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDK2P24941 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDK2P24941 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDK2P24941 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDK2P24941 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CDK2P24941 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CDK2P24941 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CDK2P24941 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CDK2P24941 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDK2P24941 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDK2P24941 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDK2P24941 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDK2P24941 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDK2P24941 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CDK2P24941 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CDK2P24941 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CDK2P24941 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CDK2P24941 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CDK2P24941 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CDK2P24941 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CDK2P24941 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CDK2P24941 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CDK2P24941 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CDK2P24941 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CDK2P24941 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CDK2P24941 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CDK2P24941 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CDK2P24941 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CDK2P24941 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CDK2P24941 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CDK2P24941 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CDK2P24941 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CDK2P24941 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CDK2P24941 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CDK2P24941 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CDK2P24941 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CDK2P24941 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CDK2P24941 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CDK2P24941 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CDK2P24941 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CDK2P24941 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CDK2P24941 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CDK2P24941 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CDK2P24941 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
CDK2P24941 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CDK2P24941 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CDK2P24941 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CDK2P24941 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CDK2P24941 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CDK2P24941 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CDK2P24941 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CDK2P24941 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CDK2P24941 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CDK2P24941 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CDK2P24941 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms