Protein–RNA interactions for Protein: P22061

PCMT1, Protein-L-isoaspartate(D-aspartate) O-methyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCMT1P22061 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PCMT1P22061 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
PCMT1P22061 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PCMT1P22061 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PCMT1P22061 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PCMT1P22061 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PCMT1P22061 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PCMT1P22061 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PCMT1P22061 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PCMT1P22061 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PCMT1P22061 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PCMT1P22061 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PCMT1P22061 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PCMT1P22061 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PCMT1P22061 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PCMT1P22061 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PCMT1P22061 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PCMT1P22061 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PCMT1P22061 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PCMT1P22061 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PCMT1P22061 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PCMT1P22061 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PCMT1P22061 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PCMT1P22061 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PCMT1P22061 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PCMT1P22061 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PCMT1P22061 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PCMT1P22061 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PCMT1P22061 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
PCMT1P22061 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PCMT1P22061 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PCMT1P22061 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PCMT1P22061 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PCMT1P22061 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PCMT1P22061 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PCMT1P22061 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PCMT1P22061 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PCMT1P22061 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PCMT1P22061 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PCMT1P22061 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PCMT1P22061 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PCMT1P22061 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PCMT1P22061 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PCMT1P22061 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PCMT1P22061 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
PCMT1P22061 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PCMT1P22061 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PCMT1P22061 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PCMT1P22061 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PCMT1P22061 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PCMT1P22061 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PCMT1P22061 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PCMT1P22061 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PCMT1P22061 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PCMT1P22061 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PCMT1P22061 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PCMT1P22061 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PCMT1P22061 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
PCMT1P22061 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PCMT1P22061 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
PCMT1P22061 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PCMT1P22061 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PCMT1P22061 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PCMT1P22061 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PCMT1P22061 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PCMT1P22061 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PCMT1P22061 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PCMT1P22061 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PCMT1P22061 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PCMT1P22061 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PCMT1P22061 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
PCMT1P22061 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
PCMT1P22061 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PCMT1P22061 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PCMT1P22061 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PCMT1P22061 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PCMT1P22061 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PCMT1P22061 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
PCMT1P22061 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PCMT1P22061 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PCMT1P22061 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PCMT1P22061 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PCMT1P22061 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PCMT1P22061 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PCMT1P22061 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PCMT1P22061 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PCMT1P22061 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PCMT1P22061 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PCMT1P22061 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PCMT1P22061 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PCMT1P22061 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PCMT1P22061 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
PCMT1P22061 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PCMT1P22061 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PCMT1P22061 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PCMT1P22061 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PCMT1P22061 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PCMT1P22061 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PCMT1P22061 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PCMT1P22061 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.6 ms